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Bonferroni correction トピック削除
No.2614-TOPIC - 2013/12/03 (火) 10:41:46 - おお
Bonferroni correctionは比較するテストがn個あればp値をn倍して補正する方法だと思いますが、そうするとp値が1を超えることがあります。この場合1としておけばいいのでしょうか。
 
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No.2614-10 - 2013/12/04 (水) 03:24:32 - おお
>[Re:6] 名無しさんは書きました :

> つまりp<α/nと書くかpxn<αと書くかの違いで(この2つ数学的に同じ式でしょ)、やってることは結局おなじこととともう。

判定するに当たっては一緒ですね。ではp値を示すとするとどちらで書いているのかという疑問もでてきますが、たいてい掛け算した値を使ってそうな感じがします。ソフトでp値が出たときどっちかわからなかったらちょっと困りますよね。

(無題) 削除/引用
No.2614-9 - 2013/12/04 (水) 03:20:10 - おお
>[Re:8] 直輝さんは書きました :
> 3で示された文献のTable 1(7ページ目)がまさにそれ、
> 0.612300x3>1だから1.00000 にしているみたいですよ。
あ、ちゃんと読めってまさにのこのことですね。。。

(無題) 削除/引用
No.2614-8 - 2013/12/04 (水) 03:08:14 - 直輝
3で示された文献のTable 1(7ページ目)がまさにそれ、
0.612300x3>1だから1.00000 にしているみたいですよ。

(無題) 削除/引用
No.2614-6 - 2013/12/03 (火) 23:44:46 - 名無し
詳しいことはあんまりよくわかんないけど割っても掛けてもどっちでもいいんじゃね、とかおもう。ていうのが、

まず割る方は、有意水準α(たとえば0.05)を検定回数nで割り算した値であるα/nを``補正された有意水準(なんとかの有意水準とか名前あったけど忘れた)``とし、これと各々のp値との比較でp>α/nなら有意差なしで、p<α/nなら有意差ありでみたいなかんじ。

掛ける方は、p値に検定回数nかけてpxn出してこれを補正してないもともとの有意水準α(たとえば0.05)と比べてpxn>αなら有意差なしでpxn<αなら有意差ありでとかな感じ。

つまりp<α/nと書くかpxn<αと書くかの違いで(この2つ数学的に同じ式でしょ)、やってることは結局おなじこととともう。

(無題) 削除/引用
No.2614-5 - 2013/12/03 (火) 15:16:33 - おお
http://stat.ethz.ch/R-manual/R-devel/library/stats/html/p.adjust.html
The adjustment methods include the Bonferroni correction ("bonferroni") in which the p-values are multiplied by the number of comparisons.

Rでも掛け算してpをだしているようですね。

(無題) 削除/引用
No.2614-4 - 2013/12/03 (火) 11:33:12 - おお
>たしかにカットオフ値をCで割るという記述もありますが。
これはほかのソースです。おそらくさいしょのBonferroniの文献なんかはそういう書き方をしていたとおもいます。

(無題) 削除/引用
No.2614-3 - 2013/12/03 (火) 11:31:07 - おお
http://www.utd.edu/~herve/abdi-Holm2010-pretty.pdf
こちらの5ページをみてください

p(Bonferroni)=Cxp
Cは何回テストしたかということです。たしかにカットオフ値をCで割るという記述もありますが。p値を示すにはちょっとむりがありますよね。

(無題) 削除/引用
No.2614-2 - 2013/12/03 (火) 11:02:03 - TK-1
>[Re:1] おおさんは書きました :
> Bonferroni correctionは比較するテストがn個あればp値をn倍して補正する方法だと思いますが、そうするとp値が1を超えることがあります。この場合1としておけばいいのでしょうか。

個々のp値をn倍して補正するより、仮にp<0.05をカットオフとしてp>0.05/nにならなかった時点で有意差がないと言うことになるだけで、何のためにn倍する???

Bonferroni correction 削除/引用
No.2614-1 - 2013/12/03 (火) 10:41:46 - おお
Bonferroni correctionは比較するテストがn個あればp値をn倍して補正する方法だと思いますが、そうするとp値が1を超えることがあります。この場合1としておけばいいのでしょうか。

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