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リン酸化チロシンを介するタンパク相互作用について トピック削除
No.2533-TOPIC - 2013/11/11 (月) 00:50:01 - まさき
いつも大変お世話になっております。
リン酸化チロシンを介するタンパク相互作用(タンパク結合)について調べています。チロシンとSH2ドメインやPTB(チロシン結合ドメイン)を介したタンパク相互作用とは別の機序で、チロシンがタンパク相互作用の強度(結合のしやすさ)を制御したり、チロシンが相互作用に必須の役割を果たす機序があるのでしょうか?これまでの研究で、あるタンパクのチロシンが相互作用に重要や役割を果たすことは分かっているのですが、相手のタンパクがSH2やPTBドメインを持っていないため、どのような機序でチロシンが相互作用を制御しているのか検討がつかず、困り果てています。
もし他の機序についてご存知の方がいらっしゃいましたら、ご教示を頂けましたら、大変勉強になります。
お忙しいところを大変お手数ですが、よろしくお願い申し上げます。
 
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(無題) 削除/引用
No.2533-3 - 2013/11/11 (月) 09:53:29 - まさき
おお様

ご教示を頂きましてありがとうございました。
お示し頂いた論文を拝見させて頂きましたが、間の仲介タンパクの存在なども含めて色々と検討する必要性があるとわかりました。Mutagenesisなども含めて更なる検討をさせて頂く所存です。
今後ともよろしくお願い申し上げます。

(無題) 削除/引用
No.2533-2 - 2013/11/11 (月) 05:50:06 - おお
構造的な話であればこれまで類似のものでも解析結果がないとちょっと難しいかもしれません。コンピューター上でインターラクションをシミュレーションするとかいう話もあったと思いますが、どこまでできるのかよくわかりませんし。

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3501258/

ここではEGFRの Y1197のリン酸かにより、Y321のリン酸かされたPDLIM1が認識するということがかかれています。

Y1197はshcによっても認識されますがPDLIM1はお示しのようなphospho tyrosine認識モチーフをもっていません。

直接構造的なことでなければ、リン酸かの状態であふぃにティーの違いとか、site direct mutagenesisなど配列をいろいろいじってみてモチーフを詳しく割り出してみるとか、bioinformaticsなアプローチでにた配列をあぶり出してみるとか、、、

どんなアプローチをお考えかわかりませんのでなんともいえませんが。

リン酸化チロシンを介するタンパク相互作用について 削除/引用
No.2533-1 - 2013/11/11 (月) 00:50:01 - まさき
いつも大変お世話になっております。
リン酸化チロシンを介するタンパク相互作用(タンパク結合)について調べています。チロシンとSH2ドメインやPTB(チロシン結合ドメイン)を介したタンパク相互作用とは別の機序で、チロシンがタンパク相互作用の強度(結合のしやすさ)を制御したり、チロシンが相互作用に必須の役割を果たす機序があるのでしょうか?これまでの研究で、あるタンパクのチロシンが相互作用に重要や役割を果たすことは分かっているのですが、相手のタンパクがSH2やPTBドメインを持っていないため、どのような機序でチロシンが相互作用を制御しているのか検討がつかず、困り果てています。
もし他の機序についてご存知の方がいらっしゃいましたら、ご教示を頂けましたら、大変勉強になります。
お忙しいところを大変お手数ですが、よろしくお願い申し上げます。

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