NCBI structureで探すと、biotinを結合したavidinの結晶データがでてきます。
biotin周辺の水素結合なり、静電ポテンシャルなりを調べてみるとよろしいです。
PDBファイルは、2AVIをPDBかNCBIのstructureからDLできます。
びゅわーは、何でもよいですが、Pymol(学生であればstudent-licence)かDeepView(free-ware)がよろしいと思います。Jmolもアリかもしれません。
まあ、結晶構造がすべてというわけではありませんが、見てみないと、「・・・と言われている」では、納得できないでしょ? |
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