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ビオチン-アビジン反応の原理 トピック削除
No.2484-TOPIC - 2013/10/24 (木) 19:49:34 -
ELISAの実験でビオチン標識2次抗体を使い、HRP標識ストレプトアビジンを使い検出を行っています。

そこで質問なのですが、ビオチンとアビジンはどのような結合で強く結びついているのでしょうか?水素結合などの非共有結合でしょうか?

もし詳しくわかる方がいましたら、教えて頂けないでしょうか。
宜しくお願い致します。
 
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No.2484-4 - 2013/10/25 (金) 09:26:43 - qq
NCBI structureで探すと、biotinを結合したavidinの結晶データがでてきます。
biotin周辺の水素結合なり、静電ポテンシャルなりを調べてみるとよろしいです。
PDBファイルは、2AVIをPDBかNCBIのstructureからDLできます。
びゅわーは、何でもよいですが、Pymol(学生であればstudent-licence)かDeepView(free-ware)がよろしいと思います。Jmolもアリかもしれません。
まあ、結晶構造がすべてというわけではありませんが、見てみないと、「・・・と言われている」では、納得できないでしょ?

(無題) 削除/引用
No.2484-3 - 2013/10/25 (金) 03:30:48 - 独り言
http://www.pnas.org/content/90/11/5076.full.pdf+html
これによるとpolarとhydrophobic interactinonです。

(無題) 削除/引用
No.2484-2 - 2013/10/24 (木) 22:09:37 - 名無し
非共有結合だけど、その結合の強さはヤバいくらい強い。たぶん非共有結合のなかでは最強だとおもう。一度結合したらこれ外すのはかなり大変で高濃度のSDS中で加熱してやっとなんとかなるかも、とかそのくらいのレベル。で、そんなに強いと困る実験もあるので、それ用に、比較的ほどほどの結合をする、なんとかアビジンとかいうのもあるらしい。名前忘れた。

結合の機序はわかんないけど、構造的には疎水結合が主体になってるのかな。

ビオチン-アビジン反応の原理 削除/引用
No.2484-1 - 2013/10/24 (木) 19:49:34 -
ELISAの実験でビオチン標識2次抗体を使い、HRP標識ストレプトアビジンを使い検出を行っています。

そこで質問なのですが、ビオチンとアビジンはどのような結合で強く結びついているのでしょうか?水素結合などの非共有結合でしょうか?

もし詳しくわかる方がいましたら、教えて頂けないでしょうか。
宜しくお願い致します。

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