全4件 ( 1 〜 4 )　 前 | 次 　1/ 1. /1

(無題) 削除/引用 No.2419-4 - 2013/10/04 (金) 08:09:43 - Harmonia ＞次世代シークエンス解析なら問題無い？ リードが短いタイプの機械だと、置き換わった配列があるため、別のサイトに マップされるのでは？

バイサルファイト処理したゲノムDNAのダイレクトシークエンス 削除/引用 No.2419-3 - 2013/10/03 (木) 20:10:59 - KIF 当たりをつけるレベルであれば、可能だということですね。 ありがとうございました。検討してみます。

(無題) 削除/引用 No.2419-2 - 2013/10/03 (木) 16:18:16 - mon ダイレクトシークエンシングでは、(1)重なった波形からはC/T割合が正確に分からない、(2)隣り合ったメチル化が連続しているのか、不連続（異なったアリル由来か別の細胞由来か）か不明、など情報量が少なくなります。（次世代シークエンス解析なら問題無い？かも） メチル化されているか否かの当たりを付ける予備実験では、ダイレクトシークエンシングも有効です。

バイサルファイト処理したゲノムDNAのダイレクトシークエンス 削除/引用 No.2419-1 - 2013/10/03 (木) 14:16:32 - KIF 複数箇所のDNAのメチル化の程度を定量的に解析するものとして、 バイサルファイトシークエンシング法が有ります。 この方法では、一般的に、ゲノムDNAをバイサルファイト処理後、 PCR増幅して、更にサブクローニングしてから、シークエンシングするとあります。 このクローニングをスキップして、直接シークエンシングする、 いわゆるダイレクトシークエンシングをやれないものでしょうか？ 可能であれば、精度の向上・時間・経費の節約が測れるように思うのですが。 この方法の是非、問題点など、ご存じの方、実際にやっている方がおられたら、 ぜひご教示ください。 よろしく。

全4件 ( 1 〜 4 )　 前 | 次 　1/ 1. /1

パスワードを入力してチェックした記事を

チェックした記事を

このトピックにメッセージを投稿する 名前  メール  　アドレス非公開    タイトル  本文       設定  クッキーを保存（次回の入力の手間を省けます） 上に上げない（トピックの一覧で一番上に移動させません） 解決（問題が解決した際にチェックしてください） 暗証  半角英数字8-12文字の暗証番号を入れると、あとで削除、修正ができます。 送信

---

〔使い方〕 「アドレス非公開」をチェックすれば、自分のメールアドレスを公開しないで他の方からメールを受け取れます。 問題が解決した際には、解決ボタンをチェックして解決した旨のコメントをつけてください。これは、初めにトピックを作った人と管理人のみが可能です。 半角カタカナ、機種依存文字(全角ローマ数字、○の中の数字等)は文字化けの原因となりますので使わないでください。

---