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バイサルファイトシークエンス
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No.2369-TOPIC - 2013/09/13 (金) 15:55:50 - バイサルファイト
初歩的な問題で申し訳ありません。
バイサルファイトシークエンスはメチル化シトシンを特定する方法ですが、
メチル化シトシン以外の化学修飾でもバイサルファイト処理が進行しない
(つまりメチル化シトシンと思っていたものが別の修飾による結果である)
可能性はないのでしょうか?
その場合はどういった修飾がバイサルファイト処理を阻害するのでしょうか?
(あるいはどういった修飾なら阻害されないのでしょうか?)
よろしくお願いいたします。
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oxBS
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No.2369-2 - 2013/09/13 (金) 17:46:50 - ~
>可能性はないのでしょうか?
可能性はあります。
というか昨年nature、cell、scienceに載ったホットな塩基がありますよね。
興味があるのでしたら論文検索してみてはいかがでしょうか。
Bisulfite法のmethodologyについては特に興味ないので、
ほかに何が該当するのかは知りませんが。
バイサルファイトシークエンス
削除/引用
No.2369-1 - 2013/09/13 (金) 15:55:50 - バイサルファイト
初歩的な問題で申し訳ありません。
バイサルファイトシークエンスはメチル化シトシンを特定する方法ですが、
メチル化シトシン以外の化学修飾でもバイサルファイト処理が進行しない
(つまりメチル化シトシンと思っていたものが別の修飾による結果である)
可能性はないのでしょうか?
その場合はどういった修飾がバイサルファイト処理を阻害するのでしょうか?
(あるいはどういった修飾なら阻害されないのでしょうか?)
よろしくお願いいたします。
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