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(無題) 削除/引用 No.2322-5 - 2013/08/27 (火) 11:02:15 - kakigouri 皆様、返信ありがとうございます。 独り言さん メーカーでは、TALENとして使用する際にはDNAの認識配列は17-24bpにしているようなのです。これはおそらく、片方のTALEドメインの推奨するDNAの認識配列の長さのことを指していると思うのですが、私はその長さをもっと伸ばせるのかどうかが知りたいのです。 おおさん 確かにTALENタンパク質の大きさのことを考えると、それだけで色々と条件が要求されてきそうですね。勉強になります。 AAさん 単純に長過ぎても良いとは言えないのですね。 もう一度、植物の論文を漁ってみることにします。

(無題) 削除/引用 No.2322-4 - 2013/08/27 (火) 09:55:40 - AA 実際に検討している人の結果を見ていましたが、長すぎるとDSBが起こる効率が下がるようでした。 認識配列を長くして特異性を上げたとしても、実際にFokで切断されるところはその配列の近辺のどこか、という感じのようですのであまり意味が無いのではないかと思います。 原理として24bpが限界なのか？という意味であればそんなことはなく、伸ばしたいだけ伸ばせるのではないかと思います。 植物の論文など探すとなにか見つかるかもしれませんね

(無題) 削除/引用 No.2322-3 - 2013/08/27 (火) 02:50:14 - おお 34aaで１塩基認識できるようですから、680aaで20塩基ですね。70-80kDaぐらいに相当するかと思います。それにfox1を加えてとなると、そのあたりのサイズを把握していませんけど、120kDaぐらいになるのかなぁ。 あまり長いと、転写、翻訳に不利になってきますので、伸ばせば伸ばすほどいいというものでもありませんでしょうし。。。 特異性が気になるといっても、24塩基認識で作ったとしてもそのうちの20塩基がマッチしたばあい、細胞の中でくっついているかもしれません。なのでstringencyのコントロールをハイぶりのようにコントロールできるわけでもないので、、、いじれるとしたら発現量でしょうか。。。

(無題) 削除/引用 No.2322-2 - 2013/08/27 (火) 02:10:18 - 独り言 質問の意図が良くわからないのですが、 １７−２４bpの認識配列が入っているDNAなら1000bpでも100000bpでも結合できると思いますが。 それとも認識配列が17-24bpと言われているのに、もっと長く認識できるかってこと？

TALEのDNA結合長 削除/引用 No.2322-1 - 2013/08/26 (月) 11:50:12 - kakigouri いつもお世話になっております。 質問させて頂きます。 TALEN技術などで使われているTALE DNA結合ドメインは最大でどれくらいの長さのDNAに結合することができるのでしょうか？ 試薬メーカーなどでは、通常17~24bpのDNAを認識するように設計する、と記述していたりしますが、原理的にはもっと長くてもいけるのではないかと思いました。 TALEのDNAに対する結合能とDNAの長さとの関係を調べているような論文を、どなたかご存知の方がいらっしゃいましたら教えて頂けませんか？ どうぞよろしくお願いします。

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