全5件 ( 1 〜 5 )　 前 | 次 　1/ 1. /1

(無題) 削除/引用 No.2246-5 - 2013/08/01 (木) 09:10:29 - ~ ・壊した部位の上流の壊れていない部位をプローブにマイクロアレイをしている。 ・フィードバックがかかっていて発現量を上げる機構が働いて、上流部分のmRNA量が増えた。 （または、壊した部位が削れている分転写の効率が上がって上流部位のmRNA量が増えた？） ・PCRでは、壊した部分を増やそうとしているので、KOでは増えない。 なら一応結果を説明できるのでは。 どのように遺伝子を壊したのかは実施したご自身が分かっていて、 プローブの配列は実施機関が教えてくれますよね？ それぞれの実験でWTとKOのどの部分を調べていて、どのような結果になることが期待されるかは、それらの情報から推測できるのでは。

あります 削除/引用 No.2246-4 - 2013/08/01 (木) 08:08:18 - KIO Microarrayではwild typeおよびK/Oともに発現（＋）でしたが qPCRおよびWestern blot analysisではK/Oのみ発現（−）でした。 メーカーに問い合わせたところmicroarrayのprobeの非特異的な反応でしょう、とのこと。

(無題) 削除/引用 No.2246-3 - 2013/07/31 (水) 23:05:26 - おお まずマイクロアレーのそのプローブの配列を確認して、その配列が破壊を行った後どうなっているかみてください。 あふぃめとであれば長さが短いので、複数のぷろーぶを使っていると思いますが、そう言う場合はすべて確認してから結論をだせばいいかと。

(無題) 削除/引用 No.2246-2 - 2013/07/31 (水) 21:45:41 - Harmonia 遺伝子を破壊した領域とマイクロアレイで検出した領域が異なる、とか？ 破壊した遺伝子と同じ配列が破壊した場所以外にある、とか？

破壊したはずの遺伝子がマイクロアレイで検出 削除/引用 No.2246-1 - 2013/07/31 (水) 20:17:17 - ru いつも利用させて頂いております。 先日、他機関でcDNAマイクロアレイ解析を依頼し結果が返ってきました。 ある遺伝子の破壊株と野生株の発現解析を行ったのですが、データを見ると破壊したはずの遺伝子の発現量が野生株よりも高くなっていました。 p-value(mut vs. WT)が8.64E-05、Ratio(mut vs. WT)が3.61767でした。 解析に供する前に同様に採取した菌体からDNAを抽出し、PCRでチェックを行いました。 その時はその遺伝子に関して、野生株ではバンドが検出され、破壊株では検出されませんでした。 これらの結果について、どのように解釈すべきでしょうか？ 同じような経験がおありの方、詳しい知識をお持ちの方ご教授下さい。

全5件 ( 1 〜 5 )　 前 | 次 　1/ 1. /1

パスワードを入力してチェックした記事を

チェックした記事を

このトピックにメッセージを投稿する 名前  メール  　アドレス非公開    タイトル  本文       設定  クッキーを保存（次回の入力の手間を省けます） 上に上げない（トピックの一覧で一番上に移動させません） 解決（問題が解決した際にチェックしてください） 暗証  半角英数字8-12文字の暗証番号を入れると、あとで削除、修正ができます。 送信

---

〔使い方〕 「アドレス非公開」をチェックすれば、自分のメールアドレスを公開しないで他の方からメールを受け取れます。 問題が解決した際には、解決ボタンをチェックして解決した旨のコメントをつけてください。これは、初めにトピックを作った人と管理人のみが可能です。 半角カタカナ、機種依存文字(全角ローマ数字、○の中の数字等)は文字化けの原因となりますので使わないでください。

---