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(無題) 削除/引用 No.2241-4 - 2013/07/30 (火) 14:56:32 - おお >[Re:3] areさんは書きました : > ダイナミックレンジに乗る、てどういう意味なのでしょうね。 要するの検出可能とか使用可能なレンジ(幅)の範囲内にあるかどうかということだと思いますよ。

(無題) 削除/引用 No.2241-3 - 2013/07/30 (火) 07:43:47 - are ダイナミックレンジに乗る、てどういう意味なのでしょうね。 ダイナミックレンジは、レンジですから、広いとか、狭いと、 続くのでは？

(無題) 削除/引用 No.2241-2 - 2013/07/30 (火) 07:13:21 - おお >[Re:1] KINGさんは書きました : >ダイナミックレンジに乗った場所にthresholdを引いてくれません このダイナミックレンジはなんのダイナミックレンジをいっているのでしょうか。蛍光強度検出可能な検出機のレンジでしょうか?それなら出てくる数字はベースラインを差し引いたりした数字であれば、引かれた下駄の部分がダイナミックレンジに入っている可能性はないでしょうか? もしそうでなければ、機械につなげるコンピューターの初期設定ミスかもしれませんので販売元またはそちらのラボに出入りしてその商品を扱っている業者にいったほうがいいかもしれません。 もしダイナミックレンジが検出されるDNA量あるいはそれから考えられる蛍光強度というなら、それは実験系によって変わってくるので、なぜレンジがわかったのかちょっとふにおちませんが、、、

realtime-PCRでのthresholdの決め方 削除/引用 No.2241-1 - 2013/07/29 (月) 16:10:25 - KING 題名の通りrealtime-PCRでのthresholdの決め方が分からなくて困っています。 機械(rotor gene Q)では自動的に指定範囲内の中でR^2値が最も１に近づくようなthresholdを探してくれるのですが、ダイナミックレンジに乗った場所にthresholdを引いてくれません。 具体的には、thresholdの探索範囲をnrom.fluoro.が0.0〜0.4(デフォルトの設定)で行ったのですが、0.0に限りなく近い場所でthresholdを引いてしまいました。 thresholdの探索範囲を0.2〜0.8にしたのですが、それでも0.2の場所で引いてしまします。ダイナミックレンジは0.2〜0.6くらいの領域です。 一般的なthresholdの引き方や求め方、また、機械はどのようなアルゴリズムでもってthresholdを探しているのでしょうか？ 何かしらヒントになるような事でも構わないのでアドバイス下さい。

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