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遺伝子とタグの間の制限酵素サイト トピック削除
No.2206-TOPIC - 2013/07/18 (木) 13:06:08 - 分子生物初心者
いつもお世話になっております。
ある遺伝子のC末端にFLAGtagをつけようと思っているのですが、設計上どうしてもその遺伝子とFLAGの間に制限酵素サイトが何個か入ってしまいます。このような制限酵素サイトが、アミノ酸に翻訳された場合、その遺伝子やFLAGの機能をおかしくさせたり、FLAGが抗体で認識されなくなってしまったりしないのでしょうか?
初歩的な質問で申し訳ございませんが、ご回答のほどよろしくお願い致します。
 
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No.2206-7 - 2013/07/18 (木) 20:28:26 - Harmonia
なります、という前提で実験を考えれば良いです。
「FLAGがついたばかりに、トピ主さんが興味を持った遺伝子の産物は本来の
機能ではないです」という意見に対して、反論を考えながら実験をすると、
「このひとはちゃんと考えているな」と思います。

(無題) 削除/引用
No.2206-6 - 2013/07/18 (木) 14:00:37 - おお
>[Re:5] 分子生物初心者さんは書きました :
> おお様
>
> ご回答ありがとうございます。
> そうです、C末です。なので、目的遺伝子にもFLAGにも無関係な制限酵素サイトが翻訳されることで、何か悪さをしないものかと思ったのです。3xFLAGにすれば、抗体で認識はされるのでしょうけど、目的遺伝子に変な機能が付け加わったり、何かおかしくなったりしないものでしょうか。

あなたの蛋白の機能に関してはFLAGが一つだけついていても、大問題になる可能性は十分にあります。なので3つにしたから影響が出ないかどうか不安であるというのは、FLAGが一つついた状態で機能しているのなら議論の余地はあるかもしれませんが、、、、
確かにTAGが大きければ(長ければ)問題が起こる可能性はたかくなります。ただよくGFPをつけたらおかしくなったというのはよくききますが、それほど大きなものではないので、、、

(無題) 削除/引用
No.2206-5 - 2013/07/18 (木) 13:50:26 - 分子生物初心者
おお様

ご回答ありがとうございます。
そうです、C末です。なので、目的遺伝子にもFLAGにも無関係な制限酵素サイトが翻訳されることで、何か悪さをしないものかと思ったのです。3xFLAGにすれば、抗体で認識はされるのでしょうけど、目的遺伝子に変な機能が付け加わったり、何かおかしくなったりしないものでしょうか。

(無題) 削除/引用
No.2206-3 - 2013/07/18 (木) 13:31:48 - おお
>[Re:2] おおさんは書きました :
> FLAGの後に続く配列は、FLAGの抗原性には理論的には関係ないはずです。もし関係あれば、つなげた遺伝子の配列によっても(間に制限酵素サイトがなくても)大きく変わる可能性があります。ただし100%大丈夫という保証は確かにありません。今までの経験からはまず検出などで変なことは起こっていません。
>
> もし気になるのであれば3xFLAGのタグにすれば、FLAGとあなたの入れたい配列に何か挟んでいて悪さしていたとしても、その上流にあと2つFLAGがついているか安心できるというのはいえるかもしれません。

---
あ、C末なら下流ですね。。。

(無題) 削除/引用
No.2206-2 - 2013/07/18 (木) 13:30:21 - おお
FLAGの後に続く配列は、FLAGの抗原性には理論的には関係ないはずです。もし関係あれば、つなげた遺伝子の配列によっても(間に制限酵素サイトがなくても)大きく変わる可能性があります。ただし100%大丈夫という保証は確かにありません。今までの経験からはまず検出などで変なことは起こっていません。

もし気になるのであれば3xFLAGのタグにすれば、FLAGとあなたの入れたい配列に何か挟んでいて悪さしていたとしても、その上流にあと2つFLAGがついているか安心できるというのはいえるかもしれません。

遺伝子とタグの間の制限酵素サイト 削除/引用
No.2206-1 - 2013/07/18 (木) 13:06:08 - 分子生物初心者
いつもお世話になっております。
ある遺伝子のC末端にFLAGtagをつけようと思っているのですが、設計上どうしてもその遺伝子とFLAGの間に制限酵素サイトが何個か入ってしまいます。このような制限酵素サイトが、アミノ酸に翻訳された場合、その遺伝子やFLAGの機能をおかしくさせたり、FLAGが抗体で認識されなくなってしまったりしないのでしょうか?
初歩的な質問で申し訳ございませんが、ご回答のほどよろしくお願い致します。

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