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(無題) 削除/引用 No.2146-4 - 2013/07/01 (月) 11:23:35 - m 的確なご助言ありがとうございました。 素人っぽい質問だったようで申し訳ありません。 勉強になりました。

(無題) 削除/引用 No.2146-3 - 2013/06/28 (金) 19:22:19 - おお >しかし、例えばボール状の立体構造モデルが示されている場合、 >表面にアミノ酸が位置しているのか、奥の方に位置しているのか >ということなどピンポイントで知ることは可能でしょうか？ えってどういう状況で知ることができるかというのがはっきりしませんが、もともとそう言うモデルはピンポイントの情報、たとえばアミノ酸のざんきのCの角度とかそういう情報をすべてインプットしてあるいはきめた状態で、そう言うモデルがアウトプットできるようになっています。文献にあるものであればそれに使った立体構造に関するデーターを持っていておそらく開示していると思いますので、それを手に入れれば、すでに回答がある方法で詳しい情報を見ることができると思います。

(無題) 削除/引用 No.2146-2 - 2013/06/28 (金) 19:04:42 - qq spdbvをダウンロードしてみると良いです。 pymolが可能であればpymolをダウンロードして使ってみると良いです。 googleで調べると出てきます。 ダウンロードの仕方や使い方は統合TVで探すとよいでしょう。

タンパク質構造モデルでの、特定アミノ酸の位置 削除/引用 No.2146-1 - 2013/06/28 (金) 18:43:13 - m いつも参考にさせて頂いております。 あるタンパク質の構造を解析して、立体構造モデルを 示している論文がよくあると思うのですが、 それに関してお聞きしたいことがあります。 例えば、何番目のアミノ酸がそのタンパク質モデルの、 具体的にどこに位置しているのかということは知ることができるのでしょうか？ アミノ酸が、あるモチーフのなかに含まれている場合、 「だいたいこの辺」というのは、わかる場合もあると思います。 しかし、例えばボール状の立体構造モデルが示されている場合、 表面にアミノ酸が位置しているのか、奥の方に位置しているのか ということなどピンポイントで知ることは可能でしょうか？ しばらく調べてみたのですが、よくわからなかったので、 何か情報ありましたら教えて頂けるとうれしいです。

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