Bio Technical フォーラム

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中胚葉マーカーを教えてください(;ω;)、Pdgfra、Cdh5など トピック削除
No.2123-TOPIC - 2013/06/22 (土) 17:24:53 - 西の彼方で困っております
内胚葉の発生分化研究者の卵です。
若輩者ですがよろしくお願い致します。

<前提>
今回、ES細胞から分化させた組織でマウス中胚葉系の発生分化効率に
変化がないことを確認しなければならず、
中胚葉系のマーカーを探しています。

<現状>
しかしながら専門外で、かつ簡単に調べられるものは解析しましたが
なかなか良いデータが得られず困っています。
(feeder細胞であるfibroblastのコンタミのせいで
 コントロール(未分化状態群)の値が高くなってしまい、
 中胚葉が分化していることがデータとして示しにくい)

Tbx6ではきれいに発現がみられ、うまくいったのですが、あと一つ、
念のためマーカーが欲しいと思っています。
なお、aSMA、Collagen 1a2、Vimentin、Desmin、S100a4については
解析しましたがきれいな差はみられませんでした。
またEMTに関連している遺伝子は軒並みダメなようです。

<お願い>
現在考えているのはPdgfra、Cdh5、Pecam1、Endoglinなどですが、
これらの遺伝子は中胚葉のマーカーとして認知されるでしょうか?

また、他に良いマーカーがあればご教示下さい。


以上よろしくお願い致します。
 
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(無題) 削除/引用
No.2123-5 - 2013/06/28 (金) 11:46:07 - 234
Flk-1が側板中胚葉
PDGFRαは沿軸中胚葉
Pecam1、Endoglinは血管内皮細胞マーカーだと思っています。

ご返答のお礼 削除/引用
No.2123-4 - 2013/06/24 (月) 09:44:15 - 西の彼方
qq様

ありがとうございました。EMAPにこのような機能があるのは知りませんでした。
面白そうですね。色々といじってみたいと思います。


HIH様

ご意見ありがとうございました。FACSなど純化できるキットも発売されているようですので検討してみたいと思います。

(無題) 削除/引用
No.2123-3 - 2013/06/23 (日) 14:59:26 - HIH
分化効率を見るという目的に対してバックが高くて正確に見れていないという実験系を組んでいる時点で問題があります。

検討された因子が上昇していない点を考えても論文投稿に耐えうるかどうか疑問です。

まずFeeder細胞の影響を排除した解析を試みるべきでは?
ES細胞培養システムはかなり整ってますから、Feeder細胞除去用のツールも市販のものが多く存在します。

(無題) 削除/引用
No.2123-2 - 2013/06/22 (土) 19:02:41 - qq
EMAP(http://www.emouseatlas.org/emage/home.php)のembryo spaceが役に立つかも。

中胚葉マーカーを教えてください(;ω;)、Pdgfra、Cdh5など 削除/引用
No.2123-1 - 2013/06/22 (土) 17:24:53 - 西の彼方で困っております
内胚葉の発生分化研究者の卵です。
若輩者ですがよろしくお願い致します。

<前提>
今回、ES細胞から分化させた組織でマウス中胚葉系の発生分化効率に
変化がないことを確認しなければならず、
中胚葉系のマーカーを探しています。

<現状>
しかしながら専門外で、かつ簡単に調べられるものは解析しましたが
なかなか良いデータが得られず困っています。
(feeder細胞であるfibroblastのコンタミのせいで
 コントロール(未分化状態群)の値が高くなってしまい、
 中胚葉が分化していることがデータとして示しにくい)

Tbx6ではきれいに発現がみられ、うまくいったのですが、あと一つ、
念のためマーカーが欲しいと思っています。
なお、aSMA、Collagen 1a2、Vimentin、Desmin、S100a4については
解析しましたがきれいな差はみられませんでした。
またEMTに関連している遺伝子は軒並みダメなようです。

<お願い>
現在考えているのはPdgfra、Cdh5、Pecam1、Endoglinなどですが、
これらの遺伝子は中胚葉のマーカーとして認知されるでしょうか?

また、他に良いマーカーがあればご教示下さい。


以上よろしくお願い致します。

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