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ラットの16sDNAの測定法
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No.2063-TOPIC - 2013/06/04 (火) 21:39:04 -
ひで
教えてください。
ラットでbacterial DNA測定を考えております。16sDNAが論文では乗っていますが具体的な方法がわかりません。便から取っているようですが方法御存じの方おられましたら教えてください。また便ではなく小腸組織から検出する方法などがあれば教えてください。
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No.2063-9 - 2013/06/06 (木) 10:10:27 - AP
この論文は読んだ?
いろんな宿主で利用され引用されているようですが。
http://mic.sgmjournals.org/content/148/11/3651.long
(無題)
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No.2063-8 - 2013/06/06 (木) 06:42:00 - おお
>[Re:6] ひでさんは書きました :
> おお さん
> ありがとうございます。人の方法でのっていますがラットでも同じでしょうか。
> かなり手間のようので簡単な方法が有ればいいんですが、、、
>
実際にどんな実験を考えているのかわかりませんのでこたえようがありません。
(無題)
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No.2063-7 - 2013/06/05 (水) 16:40:47 - aco
DNA抽出法は、ガラスビーズを用いた抽出法がグラム陽性菌からも良好にDNAが抽出されるようです。
検出方法は、特定の菌のグループをみたいならPCR法がよいと思いますし、腸内細菌叢全体の変化を見たいならT-RFLP法が適していると思います。
注意点として、ヒトとラットでは腸内細菌叢が異なります。ヒトでは検出される菌のグループが、ラットでは菌数が少なすぎる、あるいはまったく存在していなくて検出されないということもあります。
(無題)
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No.2063-6 - 2013/06/05 (水) 11:28:07 -
ひで
おお さん
ありがとうございます。人の方法でのっていますがラットでも同じでしょうか。
かなり手間のようので簡単な方法が有ればいいんですが、、、
(無題)
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No.2063-5 - 2013/06/04 (火) 22:44:47 - おお
http://www.sigmaaldrich.com/technical-documents/articles/life-science-innovations/evaluation-of-dna.html
(無題)
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No.2063-4 - 2013/06/04 (火) 22:34:14 - おお
http://rheumatology.oxfordjournals.org/content/38/3/260.full.pdf
(無題)
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No.2063-3 - 2013/06/04 (火) 22:22:48 - おお
あ、DNAか。それならPCR
(無題)
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No.2063-2 - 2013/06/04 (火) 22:21:24 - おお
RTPCR
ラットの16sDNAの測定法
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No.2063-1 - 2013/06/04 (火) 21:39:04 -
ひで
教えてください。
ラットでbacterial DNA測定を考えております。16sDNAが論文では乗っていますが具体的な方法がわかりません。便から取っているようですが方法御存じの方おられましたら教えてください。また便ではなく小腸組織から検出する方法などがあれば教えてください。
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