Bio Technical フォーラム

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real time PCRでの相対定量時の検量線について トピック削除
No.175-TOPIC - 2012/02/18 (土) 23:52:50 - 初心者
いつもお世話になっております。

real time PCRで相対定量を行うため、内部標準と標的遺伝子それぞれの
検量線を作成しようと思うのですが、このときに使用するcDNAは
両方が発現している組織から作成したcDNAの段階希釈で良いのでしょうか?

それとも、それぞれの増幅箇所を考慮したPCR産物を作成しなければならないのでしょうか?
 
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(無題) 削除/引用
No.175-3 - 2012/02/19 (日) 11:58:24 - 初心者
確かに勉強不足です。申し訳ありません。
では次の2点に質問をまとめたいと思います。

@逆転写効率を考慮すればスタンダード用のRNAをサンプルと同時に逆転写して用いるのが
ベストだと思うのですが、既にcDNAを作成している場合、データはそんなにぶれてしまうものなの でしょうか?

A プラスミドに導入したものを精製して用いるというのはコスト的に無理なので、
 cDNAをそのまま段階希釈して用いるか、cDNAをPCRで増幅させた後に段階希釈したいのですが、
 どちらがよいでしょうか?後者の場合、アガロースゲルから増幅産物を精製するという作業が必要 になりますよね?

順序は大事 削除/引用
No.175-2 - 2012/02/19 (日) 11:17:39 - たろう
まずは実験書を繰り返し読んでよく咀嚼しましょう。
聞けば適当(適切)な答えが返ってくるだろうというような姿勢は誰の為にもなりません。

real time PCRでの相対定量時の検量線について 削除/引用
No.175-1 - 2012/02/18 (土) 23:52:50 - 初心者
いつもお世話になっております。

real time PCRで相対定量を行うため、内部標準と標的遺伝子それぞれの
検量線を作成しようと思うのですが、このときに使用するcDNAは
両方が発現している組織から作成したcDNAの段階希釈で良いのでしょうか?

それとも、それぞれの増幅箇所を考慮したPCR産物を作成しなければならないのでしょうか?

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