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(無題) 削除/引用 No.1321-10 - 2013/01/12 (土) 11:34:51 - おお http://www.biocompare.com/Application-Notes/43587-Easy-Preparation-Of-Total-RNA-From-Cultured-Cells-With-TRIzol-And-Eppendorf-Phase-Lock-Gel/ こんなかんじでしょうか? 100bあたりのRNAがTRIZOLなどで抽出されて、カラムを使ったキットでは除かれてしまうというのは、各社商品説明やホームページ、テクニカルインフォメーションなどをさがせば見つかるかと思います。

(無題) 削除/引用 No.1321-9 - 2013/01/12 (土) 11:27:15 - おお >[Re:7] APさんは書きました : > >するとrRNAと考えられるバンドの他に > > 分解が起こっているなら、rRNAのバンドがスメアになるとかボケるとかの像が見えるとおもいます。 ダブレットに見えるような時もありますよね。

(無題) 削除/引用 No.1321-8 - 2013/01/11 (金) 18:16:19 - KEN small RNAという解釈で私も良いと思いますが、分解が不安ならば、バイオアナライザにかけてチェックしてみればどうでしょう？

(無題) 削除/引用 No.1321-7 - 2013/01/10 (木) 22:15:59 - AP >するとrRNAと考えられるバンドの他に 分解が起こっているなら、rRNAのバンドがスメアになるとかボケるとかの像が見えるとおもいます。しっかりとしたrRNAのバンドがある一方、分解されたRNAのサイズの小さなバンドが見えるといった、きれいに二分化されたバンドが見えるというのは考えにくいです。

(無題) 削除/引用 No.1321-6 - 2013/01/10 (木) 21:02:53 - AP 「ダイマー様」のものというのは、PCRの時のprimer dimerからの連想でしょうけれど、本来の意味から言って不適切な言葉ですねえ。 その位のサイズだと、5S, tRNA他のsmall RNAが見えているのだとしてもおかしくないでしょう。変性条件で泳動していなければ、サイズのestimateが間違っている可能性もあります。あとBPBが光っているのではないですよね。

(無題) 削除/引用 No.1321-5 - 2013/01/10 (木) 16:26:20 - おお >[Re:3] かなでさんは書きました : > バンドと言えるほど明確なものではありませんが、 > 約125bp程の位置にぼんやりと見えています。 あ、ちょっと待って。DNAのマーカーで見てるんでしょうかRNAだとbpではないですよね。んーでもまあそのあたりの解像度から考えてたいさないか。。。

(無題) 削除/引用 No.1321-4 - 2013/01/10 (木) 12:08:48 - おお tRNAや スモールRNAが来るところです。TRIZOLなら小さいRNAが落ちないのでバンドが検出可能かとおもいます。

(無題) 削除/引用 No.1321-3 - 2013/01/10 (木) 11:46:05 - かなで おおさん ご指摘ありがとうございます。 バンドと言えるほど明確なものではありませんが、 約125bp程の位置にぼんやりと見えています。 アプライする量を増やしても、ぼんやりとしたものが濃くなるだけでした。

(無題) 削除/引用 No.1321-2 - 2013/01/10 (木) 11:37:19 - おお >[Re:1] かなでさんは書きました : > このダイマーの様な物は、RNAが抽出過程で分解したものと考えていいのでしょうか？ ダイマーってなぜそう思うのかよくわかりませんけど、だいたいどれぐらいのサイズ(位置)にどのような感じのバンドがあるのか書いていただかないと答えるのが難しいと思います。

total RNA抽出確認の電気泳動について 削除/引用 No.1321-1 - 2013/01/10 (木) 10:53:22 - かなで 植物サンプルからTRizolを使用して抽出したtotalRNAを、 1.0%アガロース電気泳動で確認しています。 するとrRNAと考えられるバンドの他に、 ダイマーの様なものがありました。 このダイマーの様な物は、RNAが抽出過程で分解したものと考えていいのでしょうか？

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