Bio Technical フォーラム

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P-adjustとは トピック削除
No.13139-TOPIC - 2025/10/11 (土) 08:45:25 - Dear
RNA-seqを行い、2群で差のある遺伝子をDESeq2を使用して解析しています。
Non-codingも含めて解析したのですが、今回特にNon-codingに興味があります。

過去の論文に倣い、codingとnon-codingを別々に解析してみたのですが、一緒に解析した時に比べて、P-adjustが高くなってしまい、統計学的に差のある遺伝子が減ってしまったのですが、そういったことはあり得ますでしょうか。

つまり、サンプル数が減少しているのに、P-adjuctが上がるという現象が理解できません。

何かの間違いでしょうか。
 
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(無題) 削除/引用
No.13139-4 - 2025/10/12 (日) 21:29:41 - Dear
そもそもなのですが、調整前のp値は、個々の遺伝子毎に決定されているということですよね?

(無題) 削除/引用
No.13139-3 - 2025/10/11 (土) 11:58:01 - おお
サンプル数が減ると統計的検出力が減るのでp値は大きくなる。

(無題) 削除/引用
No.13139-2 - 2025/10/11 (土) 09:14:58 - Dear
調べてみると、P-adjustは、N数で補正して、真の差のある遺伝子を抽出する方法する方法なので、Nが増えたら、真の差のある遺伝子が減ると思ってたのですが、逆説的に、Nが増えたら、P-adjustは下がるのですね。。。

なんかしっくりきませんが。。。

P-adjustとは 削除/引用
No.13139-1 - 2025/10/11 (土) 08:45:25 - Dear
RNA-seqを行い、2群で差のある遺伝子をDESeq2を使用して解析しています。
Non-codingも含めて解析したのですが、今回特にNon-codingに興味があります。

過去の論文に倣い、codingとnon-codingを別々に解析してみたのですが、一緒に解析した時に比べて、P-adjustが高くなってしまい、統計学的に差のある遺伝子が減ってしまったのですが、そういったことはあり得ますでしょうか。

つまり、サンプル数が減少しているのに、P-adjuctが上がるという現象が理解できません。

何かの間違いでしょうか。

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