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(無題) 削除/引用 No.1294-3 - 2012/12/29 (土) 03:50:22 - おお 何か客観的にしきいちをきめられないですかねぇ。。。 というのがわたしの最初の印象です。発現が高い、低いとわけても、全体では正規分布しているのであれば、ほとんどがほぼ同じ発現量だたりするわけで、、、 発現量とのそうかん性を見るとかのほうがわかり易いと思いますけど、、、、 あとは高発現からトップ50とか、低発言からワースト50をとって真ん中は抜いて解析するとか。。。。 何か人為的に(KDとか)高発現とか低発現させているわけではないですよね。。。

(無題) 削除/引用 No.1294-2 - 2012/12/29 (土) 00:41:36 - 直輝 その遺伝子の発現量によってサンプルを１〜１００番目、１０１〜２００番目、２０１〜３００番目の３群に分けます。 そうして、第１群（１〜１００）と第３群（２０１〜３００）で生存時間解析をして有意な差が認められれば良いのでは？ 逆に、これで有意な差が認められなければ、差のある閾値を見つけるのは難しいかもしれません。 ＞時間・打ち切りのリストを入力すれば，自動で最も差の出る2群にわけるようなツール・サイト・ソフトなどご存知ありませんでしょうか？ そういうツールは知りませんが、手動にしろツールにしろ、そうやって見つけた閾値は、”クロスバリデーション＋独立した検証データ”で検証しないといけませんよ（念のため）。

生存解析 削除/引用 No.1294-1 - 2012/12/29 (土) 00:21:53 - ta お世話になります。 現在300のサンプルを，ある遺伝子の発現値から2群に分け， この2群間での生存時間解析を行おうと試みています。 どうにか発現の高低の2群間に差を見出したいのですが， その解析に難渋しています。 現在Excelを用いた解析をしていますが， サンプル数をひとつずつずらしながら解析していたのですが， （たとえば最初は150:150.これを149：151や151：149と少しずつずらしています） 手間がかかり，また労力の割に結果につながるかわからない状況です。 時間・打ち切りのリストを入力すれば， 自動で最も差の出る2群にわけるようなツール・サイト・ソフトなどご存知ありませんでしょうか？ わかりにくい文章で申し訳ありませんが， よろしくお願いします。

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