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マウスのmRNA発現量を確認できるサイト
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No.12900-TOPIC - 2025/03/27 (木) 11:16:21 - RNA
お世話になっております。
このたびとある遺伝子の解析を始めることになったのですが、どの臓器において発現量が高いかを確認したいと考えています。
自分でqPCRをする予定はあるのですが、実験結果の確からしさを確認するべく、各臓器におけるmRNA発現量を確認できるサイトを探しています。
なにかおすすめのものがございましたらご教授頂けると幸いです。
よろしくお願いいたします。
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No.12900-6 - 2025/03/28 (金) 22:17:24 - bb
自分の必要としている条件と似た(合致も含む)RNAseqのデータを論文の
サプリに公開してくれてるものもあります
ので、それらを参考にされるのがよいとおもいます。
(無題)
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No.12900-5 - 2025/03/28 (金) 13:35:04 - RNA
皆様返信ありがとうございます。
すべて鵜呑みにすることはせずに参考程度に複数のサイトで比較していこうと思います。
ありがとうございました。
(無題)
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No.12900-4 - 2025/03/28 (金) 10:20:37 - おお
NCBI のgene から個別の遺伝子検索して開くと大雑把に把握できることがあります。たまにない遺伝子や各種細胞の発現比較だったりもするけど。WIKI でもそういうデーターがあったりする。プロテインアトラスはすでに出てますが質問見て最初に浮かんだサイトです。
(無題)
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No.12900-3 - 2025/03/27 (木) 23:53:45 - mont
最近はどんどん内容が更新されていますね。
mRNAからProteomicsまで。中には技術的な問題で間違った情報が含まれる場合があるので、鵜呑みにするのは危険かな。例えば抗体の特異性が担保されていないとか。情報の海に溺れそうになります。
https://www.proteinatlas.org/
https://yslproteomics.shinyapps.io/tissuePPT/
(無題)
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No.12900-2 - 2025/03/27 (木) 12:46:08 - う
BioGPS
http://biogps.org/?full
マウスのmRNA発現量を確認できるサイト
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No.12900-1 - 2025/03/27 (木) 11:16:21 - RNA
お世話になっております。
このたびとある遺伝子の解析を始めることになったのですが、どの臓器において発現量が高いかを確認したいと考えています。
自分でqPCRをする予定はあるのですが、実験結果の確からしさを確認するべく、各臓器におけるmRNA発現量を確認できるサイトを探しています。
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