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Thermal Cycler Dice Real Time SystemでハーフスケールでqRTPCR トピック削除
No.12854-TOPIC - 2025/02/27 (木) 20:54:35 - veeeeeee
タカラバイオ社のThermal Cycler Dice Real Time System IIIで、SYBR Green Realtime PCR Master Mixを用いたRT-qPCRを行おうと考えております。
しかし、ラボの資金的な観点から、推奨されている20μLの反応系)からハーフスケールで行うべきか検討中であります。このサーマルサイクラーでは10μL系で行った際に、ターゲットの増幅を正確に検出可能なのでしょうか。
因みに96wellプレートはSARSEDTの72.1980.010を用いております。
ご回答宜しくお願いいたします。
　
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(無題) 削除/引用
No.12854-3 - 2025/03/03 (月) 10:36:27 - あの
同一機種を使っているわけでは無いので、言いにくいですが、、、

プレートは純正品を使った方が良いです

総量10ulでもABIやバイオラッドの機械なら純正品プレートの場合には問題は無いです

(無題) 削除/引用
No.12854-2 - 2025/02/28 (金) 03:05:32 - おお
qRT-PCR 2 was performed with Thermal Cycler Dice Real Time
System (Takara Bio) in a 10-ul reaction mixture containing 5 ul...

https://www.jbc.org/article/S0021-9258(20)50654-6/pdf


Quantitative real-time polymerase chain reaction analysis
Expression levels of ...using Thermal Cycler Dice-Real Time System (TaKaRa)... Reactions were carried out in a 10 μL volume...

https://www.e-algae.org/journal/view.php?number=2883

そうしているラボはあるようですね。一応タカラにも聞いてみたらいいと思います。「推奨しません」とマニュアル的対応をされるかもしれませんけど（技術系（ラボ）のひとと話したいといえばちょっと違ってくるかもですが）。

現実的なのは数Wellでいちどやってみてどれくらいばらつくものか見てみるのも手だと思います。というのもやはり手が違うと結果も異なる可能性もあるので。

でも実際にやっている人がいればコメントくれると助かりますね。

Thermal Cycler Dice Real Time SystemでハーフスケールでqRTPCR 削除/引用
No.12854-1 - 2025/02/27 (木) 20:54:35 - veeeeeee
タカラバイオ社のThermal Cycler Dice Real Time System IIIで、SYBR Green Realtime PCR Master Mixを用いたRT-qPCRを行おうと考えております。
しかし、ラボの資金的な観点から、推奨されている20μLの反応系)からハーフスケールで行うべきか検討中であります。このサーマルサイクラーでは10μL系で行った際に、ターゲットの増幅を正確に検出可能なのでしょうか。
因みに96wellプレートはSARSEDTの72.1980.010を用いております。
ご回答宜しくお願いいたします。
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