Bio Technical フォーラム

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Fastqファイルの公開 トピック削除
No.12766-TOPIC - 2025/01/01 (水) 11:00:25 - One
NGSで解析したfastqのファイルを公開したいのですが、だれでもアクセスできるのではなく、許可制にしたいと考えています。
NCBIで行うのであれば、SRAではなくdbGAPになるのでしょうか。

どなたかご経験のある方いますか。
 
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(無題) 削除/引用
No.12766-2 - 2025/01/06 (月) 17:25:15 - アー(株)
GEO(ttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/info/faq.html)に公開予定日を数年後に設定した(プライベートな)データをアップロードしておき、データをシェアする際には "reviewer token" を相手側に渡して、"read-only access"をしてもらう、という方法が原理的には可能だと思います。NGSデータを含む論文を投稿する際に利用しています。
ただし、論文が受理された後にはデータを公開する必要がありますが、データはすでにフォーマットのチェックが済んだ状態となっているため、面倒な作業をせずにスムーズに公開が可能です。

もしくはパスワードで保護したサーバーにデータをあげておけばいいかと。
ご参考まで。

Fastqファイルの公開 削除/引用
No.12766-1 - 2025/01/01 (水) 11:00:25 - One
NGSで解析したfastqのファイルを公開したいのですが、だれでもアクセスできるのではなく、許可制にしたいと考えています。
NCBIで行うのであれば、SRAではなくdbGAPになるのでしょうか。

どなたかご経験のある方いますか。

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