Bio Technical フォーラム

  • バイオ関連の実験をする上での、試薬、機器、プロトコールなどの情報交換の場です。
  • 新しいテーマで話を始める場合、質問をする場合は「新しいトピックを作る」から書き込みをしてください。
  • 質問に対して解答できる方は是非、書き込んで下さい。
  • このフォーラムにふさわしくないと管理人が判断した投稿は予告なく削除します。

新しいトピックを作る | トピック一覧 | 研究留学ネットに戻る

ひとつ前のフォーラム(readのみ)

このスレッドをはてなブックマークに追加このスレッドをはてなブックマークに追加

CRISPRでのKOに関して トピック削除
No.12738-TOPIC - 2024/12/18 (水) 05:36:11 - KO初心者
293T cellで遺伝子Aをノックアウトして、タンパク質Bの発現が上昇することを証明したく、CRISPRでKOして、遺伝子Aノックアウト293T cellのシングルクローンを作成しようと思っています。
 この際、シングルクローニングして遺伝子Aノックアウトされたシングルクローンが仮に10個樹立できた際、仮説が正しい細胞( タンパクBの発現が上昇)している細胞が10/10なのか2/10なのかで意味合いは変わると思います。
 仮説が正しいという際には、どれくらいの率であれば良いのでしょうか?2/10
でも許容されるのでしょうか?
 
- このトピックにメッセージを投稿する -



3件 ( 1 〜 3 )  前 | 次  1/ 1. /1


(無題) 削除/引用
No.12738-3 - 2024/12/18 (水) 07:50:53 - おお
KDの実験はしてますか?

(無題) 削除/引用
No.12738-2 - 2024/12/18 (水) 06:55:31 - おお
2/10ではちょっと心もとないですが、、、
色々と検証できることはあると思います。
KOされてないクローンが拾えているならどのくらいの頻度でタンパク質Bの発現上昇がみられるか。
しかしながらちょっと面倒ではありますし、それでどの程度説得力があるかよくわかりません。

もう一つはそのタンパク質Bの発現上昇が見られるクローンに過剰発現してもとに戻るか。
あるいは独立してOEで逆の減少が見られるか。

これらは10/10でも必要になってくることがたいていだと思います。

率は高いほうがいいでしょうけど、いかにして見ている減少がKOした遺伝子と関係づけられるかということだと思います。

CRISPRでのKOに関して 削除/引用
No.12738-1 - 2024/12/18 (水) 05:36:11 - KO初心者
293T cellで遺伝子Aをノックアウトして、タンパク質Bの発現が上昇することを証明したく、CRISPRでKOして、遺伝子Aノックアウト293T cellのシングルクローンを作成しようと思っています。
 この際、シングルクローニングして遺伝子Aノックアウトされたシングルクローンが仮に10個樹立できた際、仮説が正しい細胞( タンパクBの発現が上昇)している細胞が10/10なのか2/10なのかで意味合いは変わると思います。
 仮説が正しいという際には、どれくらいの率であれば良いのでしょうか?2/10
でも許容されるのでしょうか?

3件 ( 1 〜 3 )  前 | 次  1/ 1. /1


パスワードを入力してチェックした記事を チェックした記事を

このトピックにメッセージを投稿する
名前 
メール   アドレス非公開
   タイトル 
本文      
設定  クッキーを保存(次回の入力の手間を省けます)
上に上げない(トピックの一覧で一番上に移動させません)
解決(問題が解決した際にチェックしてください)
暗証  半角英数字8-12文字の暗証番号を入れると、あとで削除、修正ができます。
送信 

〔使い方〕
  • 「アドレス非公開」をチェックすれば、自分のメールアドレスを公開しないで他の方からメールを受け取れます。
  • 問題が解決した際には、解決ボタンをチェックして解決した旨のコメントをつけてください。これは、初めにトピックを作った人と管理人のみが可能です。
  • 半角カタカナ、機種依存文字(全角ローマ数字、○の中の数字等)は文字化けの原因となりますので使わないでください。