Bio Technical フォーラム

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全ゲノム 環状化 プライマー  トピック削除
No.12733-TOPIC - 2024/12/15 (日) 10:27:27 - FF
現在、2本の塩基配列である非環状化ゲノムを環状化にするために、プライマーのデザインをしようとしていますが、デザインの仕方が分かりません。

1本は1万bp、もう1本は約5000000bpで分かれており、これを繋げるには5000000bpの上流700bp+1万bp+5000000bpの下流700bpでデザインするという方法で合っていますか?
 
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(無題) 削除/引用
No.12733-3 - 2024/12/15 (日) 17:25:56 - FF
ありがとうございます!

追加です。
このゲノムをデザインするとき、Tm値やGC含量の設定などはどのくらいにすればよいのでしょうか。
設定に関しては、全く分かりません。

(無題) 削除/引用
No.12733-2 - 2024/12/15 (日) 11:55:11 - 774R
合ってます。完璧です。

全ゲノム 環状化 プライマー  削除/引用
No.12733-1 - 2024/12/15 (日) 10:27:27 - FF
現在、2本の塩基配列である非環状化ゲノムを環状化にするために、プライマーのデザインをしようとしていますが、デザインの仕方が分かりません。

1本は1万bp、もう1本は約5000000bpで分かれており、これを繋げるには5000000bpの上流700bp+1万bp+5000000bpの下流700bpでデザインするという方法で合っていますか?

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