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Creのホモ・ヘテロを判別する。
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No.12723-TOPIC - 2024/12/11 (水) 21:38:11 - RR
共同研究者からもらったKOマウスにおいて、Creがホモになると致死になると聞いているのですが、いまいち信用できないため、ホモ・ヘテロを判別したいと考えています。その上で何点か御意見をお聞きしたいことがあります。
Creがホモだとタモキシフェン投与前から致死になるケースは普通にありますでしょうか。
ホモとヘテロの判別となるとrealtimeをかけるのが王道だと思いますが、ear notchのダイレクトPCRの判別は精度が悪いということもありますか。
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No.12723-3 - 2024/12/13 (金) 06:07:53 - おお
指摘があるようにCreが入っている場所がクリティカルな場合もあると思います。
よく出回っているものならゲノムシーケンスでどこに入っているとかやってそうな気もしますけど、そんなことはないのでしょうかね。。。
(無題)
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No.12723-2 - 2024/12/12 (木) 09:33:32 - ねずみ
私の場合はGFPマウスですが、Tgホモが得られなかったという経験はあります(遺伝子判定ではなく交配で確認)。同じ配列を持つ別ラインではホモ化できたので、たまたま挿入箇所が悪かったのだろうと想像していますが、それ以上調べませんでした。
realtimeで調べるとのことなのでTgだと思いますが、もしKIなのであればCreホモだと元の遺伝子が両アレル欠損になる可能性が高いですよね。
Creのホモ・ヘテロを判別する。
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No.12723-1 - 2024/12/11 (水) 21:38:11 - RR
共同研究者からもらったKOマウスにおいて、Creがホモになると致死になると聞いているのですが、いまいち信用できないため、ホモ・ヘテロを判別したいと考えています。その上で何点か御意見をお聞きしたいことがあります。
Creがホモだとタモキシフェン投与前から致死になるケースは普通にありますでしょうか。
ホモとヘテロの判別となるとrealtimeをかけるのが王道だと思いますが、ear notchのダイレクトPCRの判別は精度が悪いということもありますか。
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