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オープンクロマチン領域の変化の指標 トピック削除
No.12660-TOPIC - 2024/10/31 (木) 14:53:08 - アセチルサリチルサザエ酸
 核に存在しているある分子を細胞株でノックアウトしたときに、ゲノム全体にオープンクロマチン領域の大きな(広範な)変化が生じるかどうかを検討したいと思っています。ATAC-seqを予定しているのですが、どのような変化が見られれば「大きな」変化が起こっていると言えるのでしょうか。何か定量的な指標があれば教えて頂けると幸いです。
 
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(無題) 削除/引用
No.12660-3 - 2024/11/02 (土) 01:29:50 - s
ATAC,H3K27AC,H3K4me3がよいと思います。

(無題) 削除/引用
No.12660-2 - 2024/11/01 (金) 05:11:09 - おお
10.1038/s42003-020-01403-4
おおきなという科学的でない表現に戸惑います。

オープンクロマチン領域の変化の指標 削除/引用
No.12660-1 - 2024/10/31 (木) 14:53:08 - アセチルサリチルサザエ酸
 核に存在しているある分子を細胞株でノックアウトしたときに、ゲノム全体にオープンクロマチン領域の大きな(広範な)変化が生じるかどうかを検討したいと思っています。ATAC-seqを予定しているのですが、どのような変化が見られれば「大きな」変化が起こっていると言えるのでしょうか。何か定量的な指標があれば教えて頂けると幸いです。

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