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(無題) 削除/引用 No.12641-7 - 2024/10/30 (水) 07:23:29 - おお >[Re:6] totoさんは書きました : > なるほど、そういう目的ですか。私は水に溶かしたRNAを使ったあとに残ったものを長期保存したい場合には等量のエタノールを加えて−20度で保存してます。たぶん半懸濁くらいになってるはず。使うときにはさらにエタノールを加えて、遠心して使えます。 > formamideにとかしておくと電気泳動の時はそのままゲルに乗せれるので、便利なときもあります。formamideは脱イオン化して−20度以下においとけば、少なくとも相当長い間、pHが変化することはないので、それ自体の分解は保存中はあんまり進行しないかなという気はしてます。 ありがとうございました。

(無題) 削除/引用 No.12641-6 - 2024/10/26 (土) 11:01:21 - toto なるほど、そういう目的ですか。私は水に溶かしたRNAを使ったあとに残ったものを長期保存したい場合には等量のエタノールを加えて−20度で保存してます。たぶん半懸濁くらいになってるはず。使うときにはさらにエタノールを加えて、遠心して使えます。 formamideにとかしておくと電気泳動の時はそのままゲルに乗せれるので、便利なときもあります。formamideは脱イオン化して−20度以下においとけば、少なくとも相当長い間、pHが変化することはないので、それ自体の分解は保存中はあんまり進行しないかなという気はしてます。

(無題) 削除/引用 No.12641-5 - 2024/10/26 (土) 02:24:08 - おお ありがとうございました。たしかに分解を防ぐのに使うという話は聞いたことがあります。わたしも水に溶かすよりかは気を使わなくていいかなというのがありましてこういう発想になりました。まあDMSOに変えたところで分解されないかというとそういう話は聞かないわけで大丈夫かと言われるとよくわからないとかしか答えられませんけど、有機溶媒中だしなという楽観的な感じで、、、 文献の提示もありがとうございました。

(無題) 削除/引用 No.12641-4 - 2024/10/26 (土) 01:17:57 - G25 formamideに溶解するというのは保存中のRNAの分解を防ぐ方法として、Chomczynski (Trizol やRNAzolの手法を確立した人)が発表したものですね。Molecular Cloningにも選択肢の一つとして載せていたはず(だけど、あんまり普及していない印象)。 https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC334043/pdf/nar00225-0241.pdf

(無題) 削除/引用 No.12641-3 - 2024/10/26 (土) 00:57:58 - おお じつはずっと前にformamideで溶かした事があって、１０mg/ml (ug/ul)を目指したんですが、結局解けずに徐々にformamideを加えていって、最終濃度がラフに８．３mg/ml ぐらいで完全に溶けたという経験がありまして。。。１０mg/ml とか切りの良い数字で溶かしたいなぁと思ってたりしていて。 formamideは劣化を防ぐためにイオン交換樹脂を入れておくとか言う話もあるので保存という意味ではそういうのが気にならないほうがいいかなぁと思ったりもしれます。まあDMSOなら劣化しなくて完璧とかいう話ではないですし、ハイブリとかシーケンスとかするわけではないので、それに影響を与える劣化がどこまでインパクトがあるのかとは思うのですが。

(無題) 削除/引用 No.12641-2 - 2024/10/24 (木) 20:38:16 - toto DMSOはやったことないですが、formamideならよく溶けますよ。エタ沈してうっかり乾かしすぎたRNAを溶かすのに使ったことあります。なのでDMFなら溶けそうですが、DMSOはどうかな。案ずるよりはやってみたほうが早いです。

RNA （tRNA）のDMSOでの溶解度 削除/引用 No.12641-1 - 2024/10/24 (木) 01:57:19 - おお RNA （tRNA）のDMSOでの溶解度を調べています。皆さんの経験などでもいいですから聞かせてください。

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