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(無題) 削除/引用 No.12627-3 - 2024/10/17 (木) 17:17:05 - おお Ensemblの遺伝子番号で人のものをマウスに当てたりしても対象の遺伝子(番号)が無いわけだし、、、 それと例えばcaspase は4、5がマウスになくてその役割はほかのcaspase が担ってるとか言うような話も聞いた事がある。オーソログが1対1の関係でないと言うか。 あとジンクフィンガータンパクでznf 番号ってなっているやつは多分マウスに、人独自にナンバリングしているせいか、同じ番号でも機能が合致してなさそうと思った事がある。 できないと言っているわけでは無いけどノイズは大きくなる可能性はあるだろう。で、異種で解析する必要性を私が思う限り感じないと思うのだけど。 と言うかどのように解析したいのだろうか？

(無題) 削除/引用 No.12627-2 - 2024/10/16 (水) 20:02:32 - asan GOは知らないけど、GSEA解析だとgene setをどうするか次第かと。 MITがだしてる有名なhallmark gene setだとヒトとマウスでそれぞれ別個にあるのでヒトのgene setを用いてマウスのデータの解析ができないってことはないと思いますけど、そのデータがヒトでとられたものという点には留意するべき場合もあると思います。

RNA-seqでマウスとヒトで解析を分けるか 削除/引用 No.12627-1 - 2024/10/16 (水) 13:43:41 - ken 連続投稿になってしまいます。 RNA-seqをマウスとヒトの培養細胞で行ったのですが、GO解析等する際には、ヒトはヒト、マウスはマウスの設定で行うことになるのでしょうか。

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