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ノックアウトマウスの解析 トピック削除
No.12605-TOPIC - 2024/10/03 (木) 09:21:31 - Mouse
とある腫瘍を発症するGEMMに、一個コンディショナルなノックアウトalleleを加えた、マウスを作出しました。つまり、腫瘍におけるこの遺伝子の機能を見たいわけです。

このケースで、-/-は必ず解析するとして、+/-と+/+の全ての組み合わせのマウスを解析する必要があるのか悩んでいます。

つまり、+/+と-/-を同時に解析すると親に+/-を持ってくるわけですが、性別やCreの分離を考えると解析できるマウスの数が減ってしまいます。

-/-と+/-であれば、-/-のマウスと+/-のマウスを親に持ってくれば、全ての子マウスが解析対象になるためです。単純計算で、+/-の両親の時の2倍です。

労力だけ考えると上記のようになるのですが、やはり、+/+と-/-の比較は必須でしょうか。
　
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No.12605-6 - 2024/10/05 (土) 01:11:14 - おお
>[Re:4] Mouseさんは書きました :
> +/+と-/-を比較する場合、+/-を入れないと、研究としては、片手落ちになるのでしょうか。


最終的に論文に乗せる図としては+/-はなしでもいいです。ただしあなたがReviewerだったらどうですか？場合によっては何らかのコメントが求められたり、質問があったりもすると思います。科学的な基本はDescriptiveでもあるので、見れるものはみとくという姿勢であるほうがベターではあります。いずれにしろ最低限（少なくともプレリミナリーでもコメントできる程度）は比較するペアー以外でも見ておいたほうがいいでしょう。予想外のことが起こる事もありますし（-/-で形質が現れなくって、+/-で現れったっていうデーターも見たことがあります）。

ところでその遺伝子はSNPsなどで解析されているものなのでしょうか？ならヘテロでのどれくらい影響があるのかとかなんとなくでもわかるかもしれません。

(無題) 削除/引用
No.12605-5 - 2024/10/04 (金) 23:08:19 - LPS
ヘテロのフェノタイプが、ノックアウトの半分とはならずに、予想外のフェノタイプを示す場合があります。また、単純に、実社会ではホモよりもヘテロの出現頻度の方が高いはずですし、そう言った意味ではヘテロの解析は、それなりに重要だと思います。
また、ひとつの試験だけでワイルドと差がないと結論するのもそれなりのリスクがあります。
ただ、これは研究の目的や予算、人力にもよるとは思います。

(無題) 削除/引用
No.12605-4 - 2024/10/04 (金) 20:14:53 - Mouse
+/+と-/-を比較する場合、+/-を入れないと、研究としては、片手落ちになるのでしょうか。

(無題) 削除/引用
No.12605-3 - 2024/10/04 (金) 07:34:12 - おお
+/-は+/+の形質が維持されていて効果が見れないこともありますが、逆に-/-に近い形質が現れることもあります。その程度も遺伝子によりけりです。+/-と-/-で比較している論文もありますが上記後者の場合差が見にくいか、見れない場合もあり得るでしょう。また+/-で形質が現れるなら+/+と+/-で比較するという流れになることもあります。

もし予備的にテストできるようでしたらそれから、本試験をすればいいかと思いますが、そうも言ってられないのであれば基本+/+と-/-で実験をスタートしたほうがいいでしょう。

(無題) 削除/引用
No.12605-2 - 2024/10/03 (木) 15:00:50 - あ
初めのうちに+/+と+/-を比較して差が無ければ以後は+/-も使えばいいと思います。それ以上は誰も答えられないかと。

ノックアウトマウスの解析 削除/引用
No.12605-1 - 2024/10/03 (木) 09:21:31 - Mouse
とある腫瘍を発症するGEMMに、一個コンディショナルなノックアウトalleleを加えた、マウスを作出しました。つまり、腫瘍におけるこの遺伝子の機能を見たいわけです。

このケースで、-/-は必ず解析するとして、+/-と+/+の全ての組み合わせのマウスを解析する必要があるのか悩んでいます。

つまり、+/+と-/-を同時に解析すると親に+/-を持ってくるわけですが、性別やCreの分離を考えると解析できるマウスの数が減ってしまいます。

-/-と+/-であれば、-/-のマウスと+/-のマウスを親に持ってくれば、全ての子マウスが解析対象になるためです。単純計算で、+/-の両親の時の2倍です。

労力だけ考えると上記のようになるのですが、やはり、+/+と-/-の比較は必須でしょうか。
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