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(無題) 削除/引用 No.12584-13 - 2024/09/26 (木) 00:19:17 - おお ジェノタイピングを外注するラボもあるみたいなので、できるならそれでもいいのかなぁ（単価はわかりませんが）。チップのコストってどれくらいなんですかね。

(無題) 削除/引用 No.12584-12 - 2024/09/25 (水) 21:56:56 - G25 100 bpと120 bpも見分けにそれはオーバースペック。モッタイナイ

(無題) 削除/引用 No.12584-11 - 2024/09/25 (水) 20:49:05 - ema アガロースを頑張るよりか、マイクロチップ電気泳動装置のようなものはどこかの研究室に無いですか？少量だとコストが気になりますが、大量だと失敗とかを考えるとそこそこの値段でジェノタイピングが出来ます。

(無題) 削除/引用 No.12584-10 - 2024/09/25 (水) 13:11:39 - noname 普通のAgaroseで5%をつくる猛者がいるというのをきいたことがあります。 さすがに扱いにくいようですが。。。 4%とかつくれるよ、とうたっているAgaroseが各社出ているので、 そちらを使って濃度を上げるのがよろしいと思います。

(無題) 削除/引用 No.12584-9 - 2024/09/22 (日) 16:15:58 - G25 agaroseもピンキリで、同じようにうまくいくとは限りませんけどね。

(無題) 削除/引用 No.12584-8 - 2024/09/22 (日) 14:22:26 - み 普通のアガロースゲルTAEでも3.5パーセントで分離可能 頑張れば4パーセントも作製可能

(無題) 削除/引用 No.12584-7 - 2024/09/22 (日) 13:16:54 - おお https://www.bio-rad.com/sites/default/files/webroot/web/pdf/lsr/literature/Bulletin_2810.pdf バイオ・ラッドのプレキャストTAE３％アガロースでの使用例です。自前で作ったものと（Fig1）と比較してます。どちらでもいいのですが、１００と２００bpの間が一番広くなっていてこの領域は分解能がかせげそうです。みなさんと同じように３％ぐらいならTAEでもいけると書こうと思ってましたが、具体的なものがあったほうがいいのかなと。 ゲルの大きさでも分解能が変わります（泳動パターン的には変わらないですが大きいほうが近傍のサイズの差がクリアになることが多いです、泳動距離も稼げますし）。 してきがすでにあるようにアガロースはLow melting agaroseと言われているものを使えば３から４％ぐらいまで扱えるようになります。人によっては通常のアガロース１％にさらにLow melting agaroseを加えてトータルで３から４％にする人もいます（いました）。アガロースでなくPAGEでやるというのも場合によっては選択肢かもしれません。

(無題) 削除/引用 No.12584-6 - 2024/09/22 (日) 12:07:01 - G25 低融点アガロース3%くらいで楽勝でしょう。なんなら4%まであげられます。

(無題) 削除/引用 No.12584-5 - 2024/09/22 (日) 11:58:58 - おっと できましたら、TBEを使いたくない理由を、簡潔で良いので開示できませんか？ 予算ですか？ 次も参考に 　https://doctor-m.xyz/tae-tbe-buffer/

(無題) 削除/引用 No.12584-4 - 2024/09/22 (日) 10:31:54 - TBE うちの同僚は、単純にAgaroseの濃度を上げてます。3%位までは普通にやってます。自分の古い経験だと、2%を超えると溶けにくくてやってられんな、と思っていたのですが、今のラボではLow temperatureで溶けるAgaroseを使っているので出来ることなのかもしれません。 私はTBE派なので試したことはないのですが、ラボでは私以外は全員3%で作ってるようです。

(無題) 削除/引用 No.12584-3 - 2024/09/22 (日) 09:23:21 - XY アガロースじゃなくて、アクリルアミドなら余裕で分離できます。

(無題) 削除/引用 No.12584-2 - 2024/09/22 (日) 09:21:39 - 774 2%ではぼやける以前にほとんど同じ位置に出ません？ 自分は近接するバンドの判別が必要な場合はもっと薄い濃度(0.6%とか)の大ゲルでやっていました。

TAEゲルで、100bpと120bpを区別するには。 削除/引用 No.12584-1 - 2024/09/22 (日) 06:36:53 - ecd マウスジェノタイピングを行っています。 TAEゲルで、100bpと120bpを区別するためのbest conditionはありますでしょうか。 2%で行うと、バンドがぼやけて判断が難しいです。 TBEだと区別できることは確認しているのですが、諸事情により、TBEは使いたくありません。

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