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Western blot用抗体は免疫染色に使えますか? トピック削除
No.12548-TOPIC - 2024/08/30 (金) 12:43:00 - ま
いつも大変勉強させていただいております。
免疫染色に使用する抗体を探していたところ、市販品ではWestern Blot用と書かれた抗体しか見つかりませんでした。Ab○camの抗体で、Westernの評価はしっかりされているのだと思いますが、この抗体を免疫染色に使用してワークする可能性はありますでしょうか?
染めてみるしかないのだとは思いますが、比較的高額な抗体のため、ある程度目星をつけてから購入したいと考えております。
素人質問で恐縮ですが、ご意見をお伺いできれば幸いです。
 
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(無題) 削除/引用
No.12548-8 - 2024/08/30 (金) 18:29:43 - 774R
細菌の成分ということなので、そもそも組織染色をするには細菌感染した組織が必要になります。メーカーとしても簡単に試せるものではないと思われます。
私なら検証してないだけだろうと楽観的に考えて、買って試すかもしれません。

(無題) 削除/引用
No.12548-7 - 2024/08/30 (金) 16:58:22 - T
提示された情報からだけでは、一般論しか出てこないし解決は難しいので、メーカーに聞くしかないように思います。当該メーカーは社内で検証実験して使えなかったアプリケーションは『ーーーには適さない』と書いてあるように思うので、何も記載なければ、免疫染色については単にまだ検証実験していないだけで、使える可能性はあると思います。
メーカーに問い合わせることについては、最近は、研究室によってはPI(教授)の許可が必要だったり、人によってはものすごく心理的ハードルが高いこともあるようですので、無理には勧めませんが、そういうことがなければ一度聞いてみるか、難しければ誰か周りのシニアの人に頼んで代わりに聞いてもらうのが良いと思います。

G25さんもコメントありがとうございます。 削除/引用
No.12548-6 - 2024/08/30 (金) 16:13:45 - ま
やはり用途によって向き不向きもあるのですね。
お話を伺う限り、WBの方が変性後の構造を認識しないといけないので、ハードルが高そうですね。凍結とパラフィンの両方で試してみたいと思います。
ちなみに、メーカーに問い合わせたところ実験結果を報告するという条件で、うまく染まらなかった場合次の購入時に使えるクーポンをもらえる制度があるようでしたので、利用して試してみたいと思っております。色々と教えていただきありがとうございます。

(無題) 削除/引用
No.12548-5 - 2024/08/30 (金) 15:38:20 - G25
大抵の場合、全然だめということはないけれど、
やってみなきゃあわからない。

免疫染色には使えるけどWesternには使えないという自作の抗体があった。
どうやら、SDS、熱里処理、還元剤で変性した標的には全く反応しない抗体のようで、どうやってもだめでWesternは諦めた。

逆に、Westernはokだけど免疫染色はうまくいかないというのは、変性状態、遊離状態なら反応できるけど、nativeな立体構造を保っていたり、架橋されていたり他のタンパク質に埋もれていたりすると、反応できないのだと考えられます。それならば、「抗原の賦活化」(標本を部分変性してエピトープを暴露する)で解決できる可能性があります。そのためのプロトコールや製品が多く利用可能ですよね。

ありがとうございます。 削除/引用
No.12548-4 - 2024/08/30 (金) 13:57:58 - ま
ひとまず、何か情報が得られないかメーカーに問い合わせてみたいと思います。
その抗体は、細菌の成分に対する抗体で、動物由来の抗原ではないのです...
ちなみに市販品はポリクロでした。既発表論文(かなり昔)で免疫染色に使われている抗体は、外国の共同研究者からもらったものと書いてあり、市販はしていないようでした。
最悪、何も染まらなければポリクロ抗体の作成を依頼する形になると思うのですが、かなり時間がかかると思いますので(メーカーのお返事次第ですが)まずは市販品で試してみたいと思います。

(無題) 削除/引用
No.12548-3 - 2024/08/30 (金) 13:14:35 - あの
それから、購入して成功する確率を高める考え方としては、モノクロよりもポリクロの方がよさそうというのもあります(そうでない場合もありえますが)。

(無題) 削除/引用
No.12548-2 - 2024/08/30 (金) 13:11:54 - あの
対象動物種(ヒトやマウスなど)や、ターゲットのおおよそのジャンル(膜タンパク)などを開示できませんか?

やってみないと判らないというのが率直なところですが、

対象動物種がヒトやマウスなどの購入者が多そうな動物種で、膜タンパクなどの難しいジャンルの場合には、どのメーカーも、ウエスタンブロットだけで使える抗体しか開発できなかったという可能性が無いとも言えないです。

購入して成功する確率を高めるには、既発表論文で使われている抗体を参照にする、などです。

それから、メーカーに問い合わせることも躊躇しない方が良いです。

Western blot用抗体は免疫染色に使えますか? 削除/引用
No.12548-1 - 2024/08/30 (金) 12:43:00 - ま
いつも大変勉強させていただいております。
免疫染色に使用する抗体を探していたところ、市販品ではWestern Blot用と書かれた抗体しか見つかりませんでした。Ab○camの抗体で、Westernの評価はしっかりされているのだと思いますが、この抗体を免疫染色に使用してワークする可能性はありますでしょうか?
染めてみるしかないのだとは思いますが、比較的高額な抗体のため、ある程度目星をつけてから購入したいと考えております。
素人質問で恐縮ですが、ご意見をお伺いできれば幸いです。

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