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(無題) 削除/引用 No.12517-5 - 2024/08/16 (金) 12:21:19 - おお 指数になっているなら乗じればいいだけだけど。。。

(無題) 削除/引用 No.12517-4 - 2024/08/16 (金) 11:07:52 - あの もし測定値Aのグラフを対数軸で示したなら、測定値Aと他の測定値Bの間の相関係数は、測定値Aの生データそのものではなく、測定値Aの生データに対する対数を用いるべきです。 X軸もY軸も対数軸で示したなら、両方とも生データそのものではなく、対数を用いるべきです。 なおリンク先は、TPMに１を足した値のLog2です。Log10ではないので注意を。

(無題) 削除/引用 No.12517-3 - 2024/08/16 (金) 11:00:16 - log 発現量XをLOG10()関数で10のN乗に変換して、Xの指数グラフからNの整数グラフに書き換えれば直線が引けると思います。 相関のRは生データXから計算してください。

対数軸で、RNAの発現の相関を見るには。 削除/引用 No.12517-1 - 2024/08/16 (金) 08:29:49 - kit TCGAのRNA-seqデータで二つの遺伝子の発現の相関を示したいと考えています。 対数で発現を見ないと、グラフの左下に固まっているようにしか見えないので、対数にしています。 nature.com/articles/nature23669/figures/6 のように、RNAの発現の相関をr値で表現したいのですが、どうやったら、この直線を描けるのでしょうか。 エクセルでやると直線近似は直線になりません。当然ですが。

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