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UTR トピック削除
No.12509-TOPIC - 2024/08/12 (月) 11:43:15 - M1
遺伝子の発現プラスミドを作る際、UTR の有無は気にしますか? coding 配列だけをクローニングしますか?
 
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No.12509-4 - 2024/08/13 (火) 00:27:50 - おお
過剰発現用に使うベクターはUTRを除いているものがたいていです(特に今は結構自由にコンストラクトが組めるので)。5’UTRの特に開始コドンあたりは残しておく人もいるようです。残さないならコザック配列を使うのが推奨されています。この辺はご自身で調べてみてください。

じゃあUTRを除いて作るのかというのは研究者のセンスの問題です。入れておけば細胞内でのmRNAの局在や発現の制御を伴うことがあります(大まかに言うとmRNAのメタボリズム)ので、その蛋白による生理的現象を突き止めるうえであったほうがいいのかもしれません。

とはいっても明確に可能性を示すものがないなかでUTRを含めることはほとんどないです。いろいろな可能性を模索するという視点に立つと、含めたものと除いたもの両方作ってみてもいいかもしれません。

(無題) 削除/引用
No.12509-3 - 2024/08/12 (月) 16:20:48 - HK
目的による。その一言。
もし過剰発現によるそのたんぱく質の機能を見たいのであれば、UTRは不要と考えていいが、発現制御までみたいのであれば入れるべき。目的による。

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No.12509-2 - 2024/08/12 (月) 15:54:48 - 独り言
ほ乳類の遺伝子の場合は、UTRは基本的には全く入れません。ATGから終止コドンまでのmRNA領域のみで遺伝子発現させます。

UTR 削除/引用
No.12509-1 - 2024/08/12 (月) 11:43:15 - M1
遺伝子の発現プラスミドを作る際、UTR の有無は気にしますか? coding 配列だけをクローニングしますか?

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