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エクソソームの表面のタンパク質について教えてください トピック削除
No.12462-TOPIC - 2024/07/24 (水) 09:17:06 - 甲斐 雄大
エクソソームの膜表面のタンパク質について調べております。
文献資料や汎用されているデータベースをトライしてみたのですが、総説レベルで数個程度がわかったのみです。
データベース。もしくはデータベースを用いた調べ方をご存知の人がおられましたらお教え下さい。
 
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(無題) 削除/引用
No.12462-5 - 2024/07/25 (木) 01:15:27 - おお
もしかして、文献などのリストを見てもどれが表面に出ている蛋白か検討がつかないということ?それで膜表面の蛋白という記述を探している?

リストをDavid bioinformaticsなどのサイトに入力してGo termなどで膜、関連蛋白など抽出すれば知らない蛋白でも網をかけることができると思う。まあ数百個ぐらいなら個別に見ていってもそんなに大変とは思わないし、どんな蛋白が存在するのかの勉強にもなると思うからそうやってもいいのではないかと思う。またそうやって調べた蛋白から今後の研究の展開の発想につながるものが見つかる可能性もあると思うし。

MISEV2018 削除/引用
No.12462-4 - 2024/07/24 (水) 20:31:29 - ema
https://labchem-wako.fujifilm.com/jp/category/lifescience/exosome/exosome_antibody/index.html

MISEV2023
https://www.isev.org/misev

(無題) 削除/引用
No.12462-3 - 2024/07/24 (水) 16:10:34 - おお
exosome proteomicsで文献調べればいいんちゃう。

(無題) 削除/引用
No.12462-2 - 2024/07/24 (水) 13:22:16 - T1
たしかにCD9とかCD63, CD81などのtetraspaninはexosomeにたくさん存在するが、これらはexosome特異的に局在する分子ではなく細胞表面にも存在する。この分野が熱いのは、exosome表面に存在する分子を調べることでexosomeを産生する元の細胞がもつ表面分子を知ることができる可能性があり、それゆえ病態特異的マーカーがあれば血液から回収できるexosomeを調べることで簡易に診断・病態判断ができるようになるという期待が大きいからだと思う。例えば、colorectal cancerはEGFR, EpCAM, GPA33, CD24の分子の内いくつか(あるいはすべて)を発現しているが、これらの分子がexosome解析で検出できるかどうかでCRCの診断できそうだとか。つまり、exosomeに発現している共通分子は何ですかというより、フォーカスしている細胞に特異的な分子(のコンビネーション)はなにかあるか、それはexosomeからも検出できるかがという個別の問いになるのだと思う。そして、これらはexosome分離法や分子の検出法にも依るので、まだ共通プラットフォーム化は難しいのではないでしょうか。

エクソソームの表面のタンパク質について教えてください 削除/引用
No.12462-1 - 2024/07/24 (水) 09:17:06 - 甲斐 雄大
エクソソームの膜表面のタンパク質について調べております。
文献資料や汎用されているデータベースをトライしてみたのですが、総説レベルで数個程度がわかったのみです。
データベース。もしくはデータベースを用いた調べ方をご存知の人がおられましたらお教え下さい。

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