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(無題) 削除/引用 No.12444-4 - 2024/07/16 (火) 14:38:03 - たまご おおさん、Dohn Joeさん ご回答いただきありがとうございました。 プローブについては、確かにアンプリコン内の特異性は見落としていました。 ありがとうございます。確認してみます。 transcript variantについては、ご回答を元にもう少し自分で調べてみます。 ありがとうございました。

(無題) 削除/引用 No.12444-3 - 2024/07/15 (月) 21:17:44 - Dohn Joe transcript variant 「ある特定の遺伝子領域から転写された複数種類の転写産物」とすると単純でよいと思いかけました。 でもこの説明だと、トップストランドとボトムストランドに分かれて同じ領域に存在する複数遺伝子の転写産物が該当してしまうかな。

(無題) 削除/引用 No.12444-2 - 2024/07/15 (月) 15:24:50 - おお >[Re:1] たまごさんは書きました : > お世話になります。 > 研究の世界に入って１年の新米です。 > > 現在リアルタイムPCRのプライマーとプローブの設計をしています。 > そこで、２点ご教授願います。 > > １.プライマーとプローブの特異性について > プライマーは目的の遺伝子に特異的な配列に設計しなければならないことは理解しています。一方でプローブはどうなのでしょうか？ > Forward primerとReverse primerの間にくっつくような配列にすれば、特異性はあまり重要でない気がします。 > プローブにも特異性は必要なのでしょうか？ 少なくともアンプリコンに対して特異性がある必要があります。例えば見た配列があり、複数箇所アンプリコンの付いたならノイズになる可能性がありますから。 > > ２.transcript variantについて > transcript variantとはなんでしょうか。転写される配列は異なるが、翻訳されるタンパク質は同じものという認識でしょうか？ Splicing variant/isoform で調べてみてください。大抵がそういうものだと思います。 >

プライマー・プローブ設計の質問 削除/引用 No.12444-1 - 2024/07/15 (月) 11:57:49 - たまご お世話になります。 研究の世界に入って１年の新米です。 現在リアルタイムPCRのプライマーとプローブの設計をしています。 そこで、２点ご教授願います。 １.プライマーとプローブの特異性について プライマーは目的の遺伝子に特異的な配列に設計しなければならないことは理解しています。一方でプローブはどうなのでしょうか？ Forward primerとReverse primerの間にくっつくような配列にすれば、特異性はあまり重要でない気がします。 プローブにも特異性は必要なのでしょうか？ ２.transcript variantについて transcript variantとはなんでしょうか。転写される配列は異なるが、翻訳されるタンパク質は同じものという認識でしょうか？ リアルタイムPCRのプライマー設計の際には、transcript variantは区別してプライマーを設計するべきなのでしょうか？ ご回答いただけると幸いです。

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