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WBのバンドが一直線出ない時の解析 トピック削除
No.12405-TOPIC - 2024/06/26 (水) 18:49:53 - まっすぐ
WBでサンプルを10個流したのですが、端っこに向かって斜めに転写されてしまいました。いつもWBの分析をするときはFijiで水平に長方形を作ってctrl+1からplot lanesでエリアを出しています。が、今回は斜めになったので、長方形を作ると端っこのサンプルでは下のバンドまで選択されてしまいます。
何かいい方法を知っている方がいたらアドバイスをお願いします。
 
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No.12405-5 - 2024/06/27 (木) 09:25:00 - TS
>たぶんレーンをまたいですべてのレーンの目的のバンドが収まるようにctrl+1で設定しているのだと思う

ああ、そういうことですね。
では1レーンずつ選べばできますね。動画もそうでしたね。
ラボによって流儀もあるようですが。

ちなみに動画でバックグラウンドを差し引いてますが(225くらいの数値)、
あれってラインツールでバックグラウンドを切る(囲む)作業をしたとしても必要なんでしょうか。何となく2回バックを引くことになってる気がしました(定量作業上、大きな問題にはなっていないとは感じましたけど)。

(無題) 削除/引用
No.12405-4 - 2024/06/27 (木) 09:13:00 - おお
>[Re:3] TSさんは書きました :
> ctrl+1で1つめ、2つ目以降はctrl+2で、Plot lanesはctrl+3ですよね。

たぶんレーンをまたいですべてのレーンの目的のバンドが収まるようにctrl+1で設定しているのだと思う。

(無題) 削除/引用
No.12405-3 - 2024/06/27 (木) 08:20:01 - TS
ctrl+1で1つめ、2つ目以降はctrl+2で、Plot lanesはctrl+3ですよね。
Plot(クロマトグラムみたいなバンドのピーク)の図で、Straightツール(線を引くツール)などを使って、バックグラウンドを切ったり、計算したいピーク囲んだ後に、Wandsで選ぶと面積値が出る、というやり方じゃないかと思うんですけど、これだとPlotのなかに別のピークがあっても普通に分離できませんか。
Straightツールを使ってないんでしょうか。もしそれだと少し不正確じゃないかなと思います。

(無題) 削除/引用
No.12405-2 - 2024/06/27 (木) 02:53:14 - おお
https://www.youtube.com/watch?v=uZGEvYxITyU

各レーンを認識させるか設定して、chromatogramからバックグランドを引いてバックグランドとchromatogramで囲われたところのエリアを計算させることができるけど、、、

あと多分レーンが曲がっていたらそれに合わせて曲げることもできたような気がする。

WBのバンドが一直線出ない時の解析 削除/引用
No.12405-1 - 2024/06/26 (水) 18:49:53 - まっすぐ
WBでサンプルを10個流したのですが、端っこに向かって斜めに転写されてしまいました。いつもWBの分析をするときはFijiで水平に長方形を作ってctrl+1からplot lanesでエリアを出しています。が、今回は斜めになったので、長方形を作ると端っこのサンプルでは下のバンドまで選択されてしまいます。
何かいい方法を知っている方がいたらアドバイスをお願いします。

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