Bio Technical フォーラム

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SDSPAGE gel size トピック削除
No.12390-TOPIC - 2024/06/23 (日) 10:40:57 - おお
SDSPAGEといえば大抵の方がMini gelを普段使っていると思います。だいたい8cm四方ぐらいのサイズでしょうか。たまに分解能など上げたいとき大きめのサイズのゲルで流したくなることはないでしょうか?
Mini gel以外のサイズのゲルもたまに使うというかたは、どんなシステム(キャスティングの装置のメーカーとか、もしぷれキャストが売っているならその商品名とか、泳動そうはどこのやつだとか)をお使いでしょうか?
 
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(無題) 削除/引用
No.12390-12 - 2024/06/25 (火) 04:47:38 - おお
>[Re:9] おおさんは書きました :

> www.gelcompanystore.com/products/cbs20-150
> www.gelcompanystore.com/collections/bio-rad-accessories/products/cbs20-100
> .75もあったはず。

https://gelcompany.com/distributors/
日本ではコスモバイオで取り扱ってるかな

(無題) 削除/引用
No.12390-11 - 2024/06/25 (火) 03:37:07 - おお
>[Re:6] egeriaさんは書きました :

> 前のレスにも一応書いていますが、バイオクラフト社の製品です。
> http://www.bio-craft.co.jp/products/pt-mini-electrophoresis/
> このページの「ロングミニゲルスラブ泳動槽」です。wideもこの会社の「ワイドミニ冷却スラブ泳動槽」を使っています。
>

あ、書いてましたね、ありがとうございました。

(無題) 削除/引用
No.12390-10 - 2024/06/25 (火) 02:01:08 - おお
>[Re:7] あさんは書きました :
> 大きいゲルで流しても拡大されるだけで、分解能は上がらないです。たかだか2倍程度の大きさのゲルですし、写真で拡大するのとかわらないんじゃないでしょうか。

とは言ってもバンドも膨れるというのはあまり考えられないとおもいます。たとえばミニゲルのキャパの2倍が大きい方のゲルのキャパだとして、ミニゲルの2倍量加えるともしかしたら画像拡大した感じになるのかもしれませんけど(それでもそこまででないとおもっている)、同じ量ならそんなにバンドが太るとは思えません(いくらかは太る可能性はありますが)。2Dとかで大きいゲルを使うのは分解能がいいからと説明されていることもあります(異論があるかもしれませんが)。

The resolution ob-
tained on a larger gel can be better than on a mini-gel, and
large gels are obviously preferable where the object of the
exercise is purification of a polypeptide,

https://link.springer.com/content/pdf/10.1007/978-3-642-60345-7.pdf
p39


> 分解能は上のバンドと下のバンドを離したい、という意味でしたら、ゲルの硬さや流す時間、バッファーはよく知りませんが、を工夫する方が良くないですか

今やっている最中です。ゲルの濃度とバッファーの工夫で重なってたバンドがなんとか分かれたところです。まだちょっとと思っているので、若干泳動時間を伸ばしてBPBが出ていくぐらいにしたらなんとかと思っていますが、泳動時間を伸ばすのも意外とバンドの太さも伸びたりすることもあります(極端にやれば顕著です)。

いろいろ探ってはいるところです。

he resolution ob-
tained on a larger gel can be better than on a min.i-gel, and
large gels are obviously preferable where the object of the
exercise is purification of a polypeptide,

https://link.springer.com/content/pdf/10.1007/978-3-642-60345-7.pdf
p39

(無題) 削除/引用
No.12390-9 - 2024/06/24 (月) 23:32:42 - おお
>[Re:8] 教えてください。さんは書きました :
> >バイオ・ラッドミニゲルにフィットする20Wellのコーム
> メーカー、型番教えていただけませんか?
>
> Bio-rad使っていますが、15 well以上流したい時がありました。

https://www.gelcompanystore.com/products/cbs20-150
https://www.gelcompanystore.com/collections/bio-rad-accessories/products/cbs20-100
.75もあったはず。

教えてください。 削除/引用
No.12390-8 - 2024/06/24 (月) 19:54:36 - 教えてください。
>バイオ・ラッドミニゲルにフィットする20Wellのコーム
メーカー、型番教えていただけませんか?

Bio-rad使っていますが、15 well以上流したい時がありました。

(無題) 削除/引用
No.12390-7 - 2024/06/24 (月) 13:32:09 - あ
大きいゲルで流しても拡大されるだけで、分解能は上がらないです。たかだか2倍程度の大きさのゲルですし、写真で拡大するのとかわらないんじゃないでしょうか。
分解能は上のバンドと下のバンドを離したい、という意味でしたら、ゲルの硬さや流す時間、バッファーはよく知りませんが、を工夫する方が良くないですか

(無題) 削除/引用
No.12390-6 - 2024/06/24 (月) 10:25:49 - egeria
> どのシステムをお使いになりましたか?バイオ・ラッドのでっかいやつですか?うちにあるにはあるけど、いろいろとデカすぎなんです。。。

前のレスにも一応書いていますが、バイオクラフト社の製品です。
http://www.bio-craft.co.jp/products/pt-mini-electrophoresis/
このページの「ロングミニゲルスラブ泳動槽」です。wideもこの会社の「ワイドミニ冷却スラブ泳動槽」を使っています。

(無題) 削除/引用
No.12390-5 - 2024/06/24 (月) 06:14:09 - おお
>[Re:4] egeriaさんは書きました :
> いまのラボでは、横幅だけmidiサイズのwideゲル、縦幅だけmidiサイズのlongゲルのゲル板があります(バイオクラフト製)。密度勾配遠心などで20-30サンプルを1枚のゲルに収めたいというケースがあるので、


そうですね。バイオ・ラッドを含め横長のシステムは見かけます。ほしいかなと思っていましたが、いろいろ探していると普通のバイオ・ラッドミニゲルにフィットする20Wellのコームがありましたのでそれでなんとか間に合わせてます。難点はコームの幅がある図では狭くって、違う図では広いとちょっと不格好かもとサイエンティフィックでないところを気にしてたりしますけど。

>精製サンプルからバンドを切り出して質量分析に送るときはlongゲルを使いました。

どのシステムをお使いになりましたか?バイオ・ラッドのでっかいやつですか?うちにあるにはあるけど、いろいろとデカすぎなんです。。。

(無題) 削除/引用
No.12390-4 - 2024/06/23 (日) 20:53:46 - egeria
いまのラボでは、横幅だけmidiサイズのwideゲル、縦幅だけmidiサイズのlongゲルのゲル板があります(バイオクラフト製)。密度勾配遠心などで20-30サンプルを1枚のゲルに収めたいというケースがあるので、wideゲルはしばしば作っています。longはめったに出番がありませんが、精製サンプルからバンドを切り出して質量分析に送るときはlongゲルを使いました。

いわゆるスラブゲル、midiサイズのゲルは使ったことがないですね。

プレキャストではBio-radのものを使ったことがあります。一般的なものとは異なり、Bio-radはmidiでも縦方向が短く、分解能はあまり高くありません。Trans-Blot Turboキットが便利なので、それにちょうど合うサイズのゲルとして使っていたという感じです。

(無題) 削除/引用
No.12390-3 - 2024/06/23 (日) 19:18:31 - おお
>[Re:2] tyujikolさんは書きました :
> 最近はミニゲルが普通ですがふた昔くらい前までは、(今から見ると)16 x 18cmくらいの大きいゲルが普通でした。``スラブゲル電気泳動装置`` で検索すればいろいろ市販されています。

私はニホンエイドウさんのたぶん15x15 cmぐらいを使ってましたが(18x18かも)、最近つかっているのをみかけなくなりましたし、ラボにを移ると、ミニゲルしか扱ってないラボばかりと言う状況なので、皆さん使わないのかなぁ、どう言うふうにやりくりしているのかなぁとおもったしだいです。普及していて手に入りやすかったり、使い勝手で問題が少ないものを考えているので、実際に使っている人の意見が聞きたいと思ってます。tyujikolさんどうですか?

(無題) 削除/引用
No.12390-2 - 2024/06/23 (日) 19:04:18 - tyujikol
最近はミニゲルが普通ですがふた昔くらい前までは、(今から見ると)16 x 18cmくらいの大きいゲルが普通でした。``スラブゲル電気泳動装置`` で検索すればいろいろ市販されています。

SDSPAGE gel size 削除/引用
No.12390-1 - 2024/06/23 (日) 10:40:57 - おお
SDSPAGEといえば大抵の方がMini gelを普段使っていると思います。だいたい8cm四方ぐらいのサイズでしょうか。たまに分解能など上げたいとき大きめのサイズのゲルで流したくなることはないでしょうか?
Mini gel以外のサイズのゲルもたまに使うというかたは、どんなシステム(キャスティングの装置のメーカーとか、もしぷれキャストが売っているならその商品名とか、泳動そうはどこのやつだとか)をお使いでしょうか?

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