Bio Technical フォーラム

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GO解析についてお教え下さい トピック削除
No.12273-TOPIC - 2024/04/13 (土) 12:44:27 - 宝井隆史
2つの方法でタンパク質を回収し、質量分析で解析した結果についてGO解析より評価をしなければなりません。例えばある方法でこのような結果が得られて、それはこのような特徴のある濃縮が認められたという方法はDAVIDで何となく理解できたのですが、2法を比較検討する方法がどうしても調べ切れません。
お恥ずかしい限りですが、どなたかご教示いただけますと幸いです。
 
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No.12273-4 - 2024/04/14 (日) 13:29:04 - 宝井隆史
おおさん、コメントありがとうございました。

ベンズさん、ご紹介の文献を読んでみます。
一致しない部分を洗い出して検討してみます。
重ねてお礼申し上げます。

(無題) 削除/引用
No.12273-3 - 2024/04/14 (日) 10:20:39 - ベンズ
共通しないカテゴリーまたは興味のあるカテゴリー内の共通しない遺伝子をベン図で見るのがいいかと思う。

これとか使えるかな?
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31130993/

(無題) 削除/引用
No.12273-2 - 2024/04/13 (土) 15:12:31 - おお
その二つの結果で違いがあるものを抽出して、エンリッチメントしているGOのカテゴリーがあるかを見るのは、あなたの実験の目的にかなって無いのですか?

GO解析についてお教え下さい 削除/引用
No.12273-1 - 2024/04/13 (土) 12:44:27 - 宝井隆史
2つの方法でタンパク質を回収し、質量分析で解析した結果についてGO解析より評価をしなければなりません。例えばある方法でこのような結果が得られて、それはこのような特徴のある濃縮が認められたという方法はDAVIDで何となく理解できたのですが、2法を比較検討する方法がどうしても調べ切れません。
お恥ずかしい限りですが、どなたかご教示いただけますと幸いです。

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