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Gal4/UAS系での遺伝子発現量? トピック削除
No.1227-TOPIC - 2012/12/08 (土) 02:58:20 - p5
Gal4/UASは
drosophilaなどで用いられる
強制発現系ですよね。

gal4はconstitutiveにuasを活性化し続けるので、
uas下流遺伝子の発現量は野生型よりかなり高くなる、
と聞いたことがあります。

実際、何倍野生型よりも発現量が高いのでしょうか?
少し探した程度は文献が見つかりませんでした。
drosophilaに詳しくご存知の方おられませんでしょうか?

よろしくお願いいたします。
 
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(無題) 削除/引用
No.1227-6 - 2012/12/08 (土) 12:09:10 - おお
>[Re:4] Harmoniaさんは書きました :
> 質問を改めて読みましたが、お答えできにくいです。
>
> 何の遺伝子をどの時期に
> Gal4はどの系統で
> UASはどの系統で
> の具体例を教えてください、

ああ、そうですね。全くそのとおりです。加えてwtの何倍って単純比較も答えようがないですね。

(無題) 削除/引用
No.1227-5 - 2012/12/08 (土) 12:04:38 - AP
まず、野生型の何倍?という質問はナンセンスだと思いませんか。
野生型の遺伝子と言っても発現量は遺伝子によって違うわけですから、一概に言えるわけないですね。GAL4/UAS系では、野生型では全く発現しない組織でも発現を誘発することができます。その場合は無限大倍ですか?
また、プラクティカルな問題として、GAL4の発現量が物によってまちまちです。GAL4を発現させるプロモータ、エンハンサーの種類のちがい、あるいはコンストラクトが挿入された場所の違いによる位置効果などによって、いろいろです。どのGAL4発現系統を選ぶかで、発現量(時間的、空間的発現の違いに加えて)は多様です。

また、目的に合わせて発現量を上げるため、下げるために、GAL4コンストラクト、あるいはUAS-標的遺伝子のコピー数を増減させたり、温度を上下させたり(通常23-25℃程度で飼育するところ、28℃にするとGAL4/UAS系による発現が増加し、18℃では下がるなど)します。

質問の答えは、「ケースバイケース」

(無題) 削除/引用
No.1227-4 - 2012/12/08 (土) 11:27:47 - Harmonia
質問を改めて読みましたが、お答えできにくいです。

何の遺伝子をどの時期に
Gal4はどの系統で
UASはどの系統で
の具体例を教えてください、

という質問になら、誰かの答えが出てくると思う。

また、その答えを聞いて、トピ主さんはどうしたいのかという出口を
示しつつ質問していただけると、より答えやすいかも。

(無題) 削除/引用
No.1227-3 - 2012/12/08 (土) 11:26:54 - おお
感触だけでいいますと、たとえばgfpとか発現した場合細胞の中で一番おおく発言しているタンパク質になるような感じだと思います。

ただ私はあまりflyの実験はしませんので(共同研究でWBの部分を手伝ったていど)、いろいろな話をきいた方がいいとは思いますが。

(無題) 削除/引用
No.1227-2 - 2012/12/08 (土) 11:17:03 - Harmonia
jfly のサイトに行き、メーリングリスト登録して質問したほうが良いと
思います。メールのフォーラムなので、匿名では議論できませんが。
あるいは、運営担当者に質問を投げてお願いするとか。

Gal4/UAS系での遺伝子発現量? 削除/引用
No.1227-1 - 2012/12/08 (土) 02:58:20 - p5
Gal4/UASは
drosophilaなどで用いられる
強制発現系ですよね。

gal4はconstitutiveにuasを活性化し続けるので、
uas下流遺伝子の発現量は野生型よりかなり高くなる、
と聞いたことがあります。

実際、何倍野生型よりも発現量が高いのでしょうか?
少し探した程度は文献が見つかりませんでした。
drosophilaに詳しくご存知の方おられませんでしょうか?

よろしくお願いいたします。

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