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核タンパクのDNA/ヒストンへの結合を示す方法 トピック削除
No.12239-TOPIC - 2024/03/23 (土) 13:35:36 - 基礎研究初心者
 核に発現しているあるタンパクが、DNAまたはヒストンに結合しているかどうかを調べようとしているのですが、どのような方法が考えられるでしょうか?
 簡便な方法があれば教えてもらえると嬉しく思います。
 
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No.12239-4 - 2024/03/25 (月) 22:14:59 - おお
>[Re:3] 杏里さんは書きました :
> 核に発現しているのに、核またはヒストンに結合していないなんて事有るの(酸性でも塩基性でも無いって事よね)?
> 有るとしたら何の為に核に有るの?

RNAのプロセッシング。色々なプロテアーゼも核内にあって核内の現象を制御している。クロマチンの空間的制御のためにアクチン(様)タンパクや、ミオシンなども核内にある様です。

(無題) 削除/引用
No.12239-3 - 2024/03/25 (月) 09:24:04 - 杏里
核に発現しているのに、核またはヒストンに結合していないなんて事有るの(酸性でも塩基性でも無いって事よね)?
有るとしたら何の為に核に有るの?

(無題) 削除/引用
No.12239-2 - 2024/03/24 (日) 10:09:51 - おお
Nucleosomeを購入する。
https://bpsbioscience.com/catalog/product/view/id/1275/s/native-nucleosome-hela-derived-52039/

クロマチンなどのプロテオミクスのデーターをみてみる。
doi.org/10.1038/s41586-024-07141-5
doi.org/10.1073/pnas.1502971112

Interactionのデーターベースなどからあなたの考えている蛋白と、ヒストンが相互作用していることを示データーを見つける。
そのた生化学的、分子生物学的手法を用いる(IP、Gel shift、精製蛋白同士でのプルダウンなど上げたらきりがなさそう)。

核タンパクのDNA/ヒストンへの結合を示す方法 削除/引用
No.12239-1 - 2024/03/23 (土) 13:35:36 - 基礎研究初心者
 核に発現しているあるタンパクが、DNAまたはヒストンに結合しているかどうかを調べようとしているのですが、どのような方法が考えられるでしょうか?
 簡便な方法があれば教えてもらえると嬉しく思います。

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