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Pearsonの相関係数の解釈 トピック削除
No.12134-TOPIC - 2024/02/04 (日) 12:44:31 - TE
遺伝子AとB-Dの発現に関して、既存のデータベースで、相関を見ています。
TCGAのデータベースを使っているのですが、Pearsonの相関係数がいずれの組み合わせも、極めて低い0.12-0.06等なのですが、リグレッション直線自体は、正に傾きを持っています。この場合、論文では正の関係があるとは言ってはいけないですよね?
 
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(無題) 削除/引用
No.12134-3 - 2024/02/06 (火) 07:13:20 - おお
詳しいものではないのですが色々勉強させてもらってだいたいこんなもんかなと言うことを書いておきます。

例えば平面上にランダムに点を打っていきますと相関係数0となるはずです。ただし数点打ってもたまたまある程度相関がありそうな位置にあって相関係数が0にはならないことがあると思います。でも点を増やしていくと0に近づいていくはずです。そういう理想的な状況下で0.06であるなら相関性があると言わざる終えません。また、相関を見るにあたっての仮定が直線性があるということに基づいています。緩やかに増えていって徐々に頭打ちに近くなるような相関であれば、ばらつきに隠れがちになってしまって高い相関係数が望めないかもしれません。

一応0.3未満は弱い相関という分類に入れられることが多いです。じゃあ0に近い場合それでほんとに相関があるのという疑問はつきものかと思いますが、帰無仮説を相関性がないとさだめて検定する方法があります。できればそうしたほうがいいと思いますし、統計ソフトSPSSなどにはその手順の解説も書いています。もちろん検定するのに十分な検出力があるほどサンプルが集まっているかどうかという問題もありますのでその観点からもあてになる数字とは言えません。

そうじて0.06で相関があることが示唆されたということは絶対的にだめとまでは言えません。

しかしながら色々見てみますと0.1未満はNegligibleとすることが多いようです。また相関が直線的であるという前提では0.3未満はNegligibleとするのも見かけました。

サンプル数その他のデーター、その結果のその論文における位置づけいろんなファクターが絡むことを考えると、絶対こうだというのはないと思っています。データーを示しているのでしょうからそれをみて見た人が判断すればいいのかと思います。

https://latrobe.libguides.com/ibmspss/correlation

(無題) 削除/引用
No.12134-2 - 2024/02/04 (日) 12:59:00 - あの
詳細は、次などを見てほしいですが、

https://best-biostatistics.com/correlation_regression/r-square.html


ざっくり言うと、
 相関係数rのニ乗が決定係数R2で
 目的変数がどれだけバラつくかについて説明できる割合(寄与率)が決定係数

です。たとえば
 rが0.3なら、決定係数は0.09となり、
 目的変数のバラツキの9%だけが、説明変数の変化に伴い変化したと言える

という感じです。これを基に考えれば良いです。

より正確な説明は、詳しい方の書き込みを待ちましょう。

Pearsonの相関係数の解釈 削除/引用
No.12134-1 - 2024/02/04 (日) 12:44:31 - TE
遺伝子AとB-Dの発現に関して、既存のデータベースで、相関を見ています。
TCGAのデータベースを使っているのですが、Pearsonの相関係数がいずれの組み合わせも、極めて低い0.12-0.06等なのですが、リグレッション直線自体は、正に傾きを持っています。この場合、論文では正の関係があるとは言ってはいけないですよね?

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