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(無題) 削除/引用 No.12100-4 - 2024/01/28 (日) 05:50:36 - 福岡 みなさま御回答有難う御座いました。 大変参考になりました。

(無題) 削除/引用 No.12100-3 - 2024/01/26 (金) 06:08:18 - おお https://www.sigmaaldrich.com/deepweb/assets/sigmaaldrich/product/documents/388/028/flag_ha_tap_poster.pdf 一般的な昔からあるChipアッセイにはHigh stringencyなバッファー（RIPA)が使われる事が多いのでそれならそれに耐えうる抗体を使うことを考慮する必要があると思います。 上記に示したURLではFLAGに対してAnti flag M2 clone、HAに対してAnti HA HA-7 CloneをつかってRIPAバッファーのWashで十分耐えられることが示されています。 いずれにしろ３xFLAGとかタンデムにつなげたエピトープタグのほうがよろしいかと。またCHIPを意識してCHIPグレイドとかで売られているものならある程度は安心かもしれません。HAやMycはAbcamからChip gradeの商品が出てますね。FLAGはジグマの専売？だと思われますが、Anti flag M2 cloneでCHIPをしている論文は見かけます。HAにはリジンがないねぇ。 Mycのエピトープは内在性のMyc遺伝子（か、vーMyc）から取られたと思いますが、このエピトープの配列はマウスのMycの配列とは一致しませんので細胞内のMycをIPすることはなさそうです。ただ人の場合エピトープが一致すると聞いたことがありますが、内在性のMycを検出したというのは聞きません、ただCHIPだとMycがDNA結合蛋白なので気持ち悪いですね。今回はマウスということですので余計な心配かもしれません。

(無題) 削除/引用 No.12100-2 - 2024/01/24 (水) 19:51:00 - み Ty1 タグ; タグの配列にLysがないんで、クロスリンクの影響がない FLAG タグ; Lysあるけど、M2抗体が素晴らしいので十分ChIP-seqにつかえる。今からconstructionするなら、SuperFLAGとM2の組み合わせがbetter

Chip-seqに用いるエピトープタグ 削除/引用 No.12100-1 - 2024/01/24 (水) 14:19:00 - 福岡 　マウス由来の癌細胞にエピトープタグ付きタンパクを発現させてChip-seqを行おうとしているのですが、一番良いエピトープタグは何でしょうか？理由とともに教えてもらえると嬉しいです。

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