培養したい目的と細菌叢を維持したい目的はなんでしょうか。
細菌叢を維持したいというのは全ての菌を網羅的に培養したいだけではなくて、その組成・割合まで維持したいという意味でしょうか。
また、その臓器にはどれくらいの種類の菌がそれぞれどれだけの量存在していると推測されるのでしょうか。
臓器に存在する細菌を培養するのは簡単です。
臓器破砕液を寒天培地に塗布→シングルコロニーを液体培地で増やす
という定石があります。
問題は、全体の細菌叢を維持するという点です。
全ての細菌を網羅的に培養できる培地(寒天にしろ液体にしろ)は存在しません。そもそも培養法が確立していないバクテリアがいます。
もし、質問者様の目的が、
・臓器の菌叢を解析すること
・それらの菌を単離すること(その後別の実験に使う目的で)
ということでしたら、前者と後者を別々の実験にすることをお勧めします。
例えば、前者はNGSなどで解析できるでしょう。
その後、どんな菌が存在しているのか大まかにわかったら、それらの菌種を増やせる選択培地をさまざまな種類用意し、プレーティングで単離するのが良いと思います。
選択培地の種類、供気条件、培養温度は先行研究に則るか、自分で検討する必要があると思います。 |
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