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Nanoporeのモータータンパクについて トピック削除
No.12057-TOPIC - 2024/01/04 (木) 10:44:21 - fasy
Nanoporeシ―クエンス解析について疑問がありまして、ご存じの方おられるでしょうか?
バーコードタグならびにアダプターの付加後、HPのアニメ―ションを確認する限りはモータータンパクがナノポア膜の通過を補助しているように見えます。

しかし市販のNanoporeキットを使用した場合、モータータンパクはどこにも添加されていないように思われるのですが、このタンパクはどの段階で添加されるのでしょうか?
もしくは、決して必要なものではないのでしょうか?

何卒宜しくお願い致します。
 
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(無題) 解決済み 削除/引用
No.12057-3 - 2024/01/04 (木) 20:31:33 - fasy
G25さん、返信ありがとうございました。

確かに言われるようにタンパクの固まりが見られますね。
ありえるならと考えていましたが、やはりアダプターに付加されているのですね。
ありがとうございます。理解できました。

(無題) 削除/引用
No.12057-2 - 2024/01/04 (木) 17:44:28 - G25
sequencing adapter に予めくっついているものだと理解していましたが。
protocol overviewなんかのイラストではアダプターDNAの突出末端にダンゴみたいのが刺さっていますが、それじゃないですか。
https://images.ctfassets.net/obrbum38fjyj/6GvtkTueXdKteltcU4q7LN/55d6a9dde6245fd5d8078a835d4f0074/2018_05_30_LSK109_workflow_v1_DS.svg

Nanoporeのモータータンパクについて 削除/引用
No.12057-1 - 2024/01/04 (木) 10:44:21 - fasy
Nanoporeシ―クエンス解析について疑問がありまして、ご存じの方おられるでしょうか?
バーコードタグならびにアダプターの付加後、HPのアニメ―ションを確認する限りはモータータンパクがナノポア膜の通過を補助しているように見えます。

しかし市販のNanoporeキットを使用した場合、モータータンパクはどこにも添加されていないように思われるのですが、このタンパクはどの段階で添加されるのでしょうか?
もしくは、決して必要なものではないのでしょうか?

何卒宜しくお願い致します。

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