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増殖細胞だけで検出できる トピック削除
No.12021-TOPIC - 2023/12/19 (火) 23:05:27 - 増殖
ちょっと知恵を貸してください。
ある遺伝子Aをある臓器で強制発現させるトランスジェニックを作りました。タンパク質Aに対する抗体で免疫染色すると、その臓器の中で増殖している細胞でだけシグナルが検出できました（他の多くのタンパク質は同じ方法で過剰発現させるとその臓器の全ての細胞で過剰発現することが検出できます）。

以上の結果から、Aがどんな機能、どんな性質を持ったタンパク質だと予想できますでしょうか（なぜ増殖しない細胞では検出できないのでしょうか）。ハウスキーピングのようなタンパク質で、分子名からは機能が予想できません。リボソームタンパク質の合成に関係してそうだということだけは予想されています。
　
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No.12021-7 - 2023/12/22 (金) 20:44:45 - おお
抗体が目的のものを検出しているかも重要なところだけど、目的のものを認識していたとしても、増殖している、していないで、修飾などの状態が変わるとそんざいしても検出できないかもと言う事が最初のコメントで言いたかったことの一つです。

(無題) 削除/引用
No.12021-6 - 2023/12/22 (金) 18:47:11 - み
外から導入した遺伝子を発現させるためのプロモーターは何を使用されたのか？
どのように遺伝子改変された動物なのかを理解しないとね。
他の人も指摘している通り抗体が本当に標的蛋白を検出している保証は？

(無題) 削除/引用
No.12021-5 - 2023/12/22 (金) 18:16:46 - おお
免疫に関する細胞だと活性化に伴い増殖して、機能を果たすものもあるから、その機能に関係するタンパク質の可能性もあるし、組織再構築の際に増殖が見られるが、再構築の際にマトリックスプロテアーゼが発現したりもする。細胞内ののものであっても、そう言うプロテアーゼを活性化するとカスケードを構成するタンパクのひとつかもしれない。

(無題) 削除/引用
No.12021-4 - 2023/12/20 (水) 12:01:15 - nan
増殖中の細胞ってBrdU+ということでしょうか。
また、強制発現自体は臓器依存性はなくてどんな臓器でも必ず発現することが担保されているということでしょうか。

臓器が何かわかりませんが、
例えば腸管上皮細胞であれば幹細胞だけがBrdU+になります。
であれば、幹細胞の維持や強力な増殖維持に関わっていて、
通常細胞では分解されて機能が抑制されるとか？(がん化の阻止?)

(無題) 削除/引用
No.12021-3 - 2023/12/20 (水) 07:25:13 - qq
可能性の一つとして、その抗体は本当にタンパク質Aを見ているのですか？

(無題) 削除/引用
No.12021-2 - 2023/12/20 (水) 02:46:22 - おお
それだけではちょっと無理ゲーだと思う。
一つ言えるかもしれない事は増殖に関係する可能性。あるいは増殖に伴って機能を果たすタンパク。

細かいこと言うと発現が検出できないと発現していないは同義ではない。

ribosomeも老化細胞で発現が低下すると言う結果も報告されている。ならば増殖に伴ってribosome発現が促進される可能性もあるのかもしれないので、文献の調査をしたらどうか。

ある組織で増殖していると言う表現も捉えようがない。組織構築の過程の増殖ならやがて組織で増殖が止まって分化する可能性もあるわけで、その場合、分化の過程で必要なのかもしれない。ただし、組織構築が終わったあとでの増殖を認められる組織もあるだろうから、それなら分化の過程というのは当てはまらない。

培養細胞レベルでいいから、KDかKOでもしてみてもいいかもしれない。

増殖細胞だけで検出できる 削除/引用
No.12021-1 - 2023/12/19 (火) 23:05:27 - 増殖
ちょっと知恵を貸してください。
ある遺伝子Aをある臓器で強制発現させるトランスジェニックを作りました。タンパク質Aに対する抗体で免疫染色すると、その臓器の中で増殖している細胞でだけシグナルが検出できました（他の多くのタンパク質は同じ方法で過剰発現させるとその臓器の全ての細胞で過剰発現することが検出できます）。

以上の結果から、Aがどんな機能、どんな性質を持ったタンパク質だと予想できますでしょうか（なぜ増殖しない細胞では検出できないのでしょうか）。ハウスキーピングのようなタンパク質で、分子名からは機能が予想できません。リボソームタンパク質の合成に関係してそうだということだけは予想されています。
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