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(無題) 削除/引用 No.11970-3 - 2023/12/05 (火) 20:42:53 - fy LC-MS分析は外部委託でなくいて自分でするのですか。

(無題) 削除/引用 No.11970-2 - 2023/12/04 (月) 08:50:11 - おお >具体的なサンプル中の不純物やタンパク質などを取り除くための、 何を持って不純物とするのかよくわかりませんが、培地にある有機物は培地成分を除いてすべて代謝物ではないですか？ そういう実験はしたことがないので、知っている知識などで書くとタンパクはTFAや有機溶媒を加えて沈殿させて除くことが多いようです。そのうえでC18逆相で分離してMSに持っていくことが多いと思います。また見たいターゲットによっても細分化されているようで方法論はどんなものを見るかによっても違いがあるようですが、、、 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8229076/ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2607197/ 総論などをいくつか読み漁って自身にあった方法を構築するか、似た実験をしている論文を探すかされたほうがいいと思います。 >使用する無血清培地などがわかれば教えてほしいです。 それはあなたの実験によって細胞をどういう状態にしたいかによっても変わりますよね。毛乳頭細胞増殖培地として微量の血清を使う培地は売られているようですけど。

細胞培養液上澄みのLC-MSについて 削除/引用 No.11970-1 - 2023/12/03 (日) 18:58:39 - M1 初心者 細胞培養上清や培養細胞内の代謝物の経時変化を評価するためのLC-MS（液体クロマトグラフィー質量分析法）の手順を知りたいです。 具体的なサンプル中の不純物やタンパク質などを取り除くための、適切な前処理方法、使用する無血清培地などがわかれば教えてほしいです。使う細胞は毛乳頭細胞であり、サンプルとしてあるタンパク質をノックアウトしたものを使用する予定です。

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