Bio Technical フォーラム

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solubleタンパク質の実験 トピック削除
No.11952-TOPIC - 2023/11/28 (火) 02:53:27 - KDDI
私の所属しているラボは、膜たんぱく質から切り出されるsolubleタンパク質とともに、全く異なるテーマとして、エンドサイトーシスも行われています。

何か新しい知見を得たいと思い、上記の市販のsolubleタンパク質を購入し、エンドサイトーシスのassayを組み合わせたところ、たんぱく質を加えた場合に、30%ほどエンドサイトーシスが阻害されました。

再現性は何度も取れるのですが、何かアーティファクトを見ている気もしています。何せ、全く関係のない実験を組み合わせて偶然この結果が出ていますので。

例えば、phrodoと組み合わせているので、phrodoを阻害するということもあり得るのではとか、無数の可能性が考えられますが、実験結果を積極的に否定することも考えずらいです。

この結果を素直に受け入れて、次に進むことを皆さんどう思われますか。
 
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(無題) 削除/引用
No.11952-2 - 2023/11/28 (火) 03:29:17 - おお
面白いとは思いますし、そういう予想もできないところから新たな研究が始まることがあるというのも本当だと思います。最初はウエイトの置き方を軽めにしてちょっとずつデーターを集めていってもいいのではないかと思います。一つの実験で可能性を肯定できたり否定できることは少ないです。否定的要素をちょっとずつ否定して行くのもやり方かも知れません。あと何らかのコントロールがほしいですね。そのタンパクの購入先でなにか関係なさそうなタンパクを購入してみるとか、あるいは自身でほぼ同じ要領でそのタンパクとなにか関係のないタンパクを精製してみるとか。

膜たんぱく質から切り出されるsolubleタンパク質とのことですが、そのsolubleタンパク質を産生している細胞のConditioned mediaなんかもあれば使えると思います。

phrodoの阻害はpH5の溶液にphrodoとタンパクを混ぜて蛍光を測ればどうかな。

solubleタンパク質の実験 削除/引用
No.11952-1 - 2023/11/28 (火) 02:53:27 - KDDI
私の所属しているラボは、膜たんぱく質から切り出されるsolubleタンパク質とともに、全く異なるテーマとして、エンドサイトーシスも行われています。

何か新しい知見を得たいと思い、上記の市販のsolubleタンパク質を購入し、エンドサイトーシスのassayを組み合わせたところ、たんぱく質を加えた場合に、30%ほどエンドサイトーシスが阻害されました。

再現性は何度も取れるのですが、何かアーティファクトを見ている気もしています。何せ、全く関係のない実験を組み合わせて偶然この結果が出ていますので。

例えば、phrodoと組み合わせているので、phrodoを阻害するということもあり得るのではとか、無数の可能性が考えられますが、実験結果を積極的に否定することも考えずらいです。

この結果を素直に受け入れて、次に進むことを皆さんどう思われますか。

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