Bio Technical フォーラム

  • バイオ関連の実験をする上での、試薬、機器、プロトコールなどの情報交換の場です。
  • 新しいテーマで話を始める場合、質問をする場合は「新しいトピックを作る」から書き込みをしてください。
  • 質問に対して解答できる方は是非、書き込んで下さい。
  • このフォーラムにふさわしくないと管理人が判断した投稿は予告なく削除します。

新しいトピックを作る | トピック一覧 | 研究留学ネットに戻る

ひとつ前のフォーラム(readのみ)

このスレッドをはてなブックマークに追加このスレッドをはてなブックマークに追加

血漿サンプルを用いた定量試験 トピック削除
No.11932-TOPIC - 2023/11/19 (日) 21:13:33 - きあいのタスキ学部6年生

現在、血漿サンプルを用いて目的の産物の定量試験(質量分析機器)を行っております。
予備試験として、以前の古い血漿サンプル(目的の産物は入っていない)を用いて、目的の産物がないのを確認と実験操作のおさらいをしております。
ただ、ここで問題が発生しました。
本来、目的の産物が入っていないサンプルから、当該ピークを検出してしまいました。
コンタミを疑い、調製した試薬を全て打ってみましたが、ピークは検出されませんでした。
また、base(水)でもピークは検出されません。
なぜか、目的の産物が入っていない血漿サンプルを用いても当該ピークを検出します。
マトリクス効果が原因でしょうか。

追記
カラムは古いカラムではなく、新しいカラムを使用しております。
さらに、一番最初に目的の産物をµMレベルでスタンダードとして打っております。そのRTを参考に、ピークの検出を確認しております。
 
- このトピックにメッセージを投稿する -



7件 ( 1 〜 7 )  前 | 次  1/ 1. /1


(無題) 削除/引用
No.11932-7 - 2023/11/22 (水) 23:36:01 - SN
投与物が本来は生体内に存在しない化合物であると仮定して、測定中の試薬や新しいカラムでコンタミが確認されないとのことなので、血漿を再凍結する過程でコンタミした可能性が高いのではないでしょうか。
別の血漿で同じ操作をしてみて、確認してみるのも原因を探る上では一つの手段になるかと。

(無題) 削除/引用
No.11932-6 - 2023/11/20 (月) 13:56:14 - きあいのタスキ学部6年生
SNさんコメントありがとうございます。

以前、測定した血漿と同じとのことですが、どのように保存されていたのですか?凍結融解を繰り返したりしていますか?

これに関しては、血漿使用後液体窒素で凍結乾燥後、冷凍庫に保管しております。

(無題) 削除/引用
No.11932-5 - 2023/11/20 (月) 09:14:37 - SN
目的物質を投与して、血漿中に存在する量を測っているのですね。
MSMSが使える装置なのであれば、検出されているものが本当に同じ物質なのかほぼ確認できると思います。
以前、測定した血漿と同じとのことですが、どのように保存されていたのですか?凍結融解を繰り返したりしていますか?

(無題) 削除/引用
No.11932-4 - 2023/11/20 (月) 08:53:45 - きあいのタスキ学部6年生
あのさん、SNさん
ご意見ありがとうございます。

3点 疑問があります。

(1)何を理由に、その古い血漿には、目的の産物が無いと判断したか
→古い血漿には、目的の産物を投与しておりません、コントロール血漿になります。

(2)RTだけではなく、msmsも含めて、目的の産物の有無を判定しているか。RTが同じ別の物質が存在する可能性はあるえますので。
→MSMSは行っておりません。本日確認してみます。

(3)その産物は、古い血漿を保存している最中に作られる可能性は無いか
→その可能性は低いです。以前、別の古いカラムで試した際は確認されませんでした。

(無題) 削除/引用
No.11932-3 - 2023/11/20 (月) 07:38:22 - SN
詳しい実験系を書かれた方が、コメントが得られやすいかと思います。
用いている動物モデル、どういった産物を測定しているのか(内在性の分子、投与した薬物、など)、使用したカラム・溶媒、血漿サンプルの調製方法、など

あのさんも質問されていますが、質量分析はmsmsまで測定されていて、フラグメントからも目的の分子であることを確認されていますか。
用いられている溶媒、新しいカラムがコンタミしていないことは分かるので、内在性の物を検出してしまっているのか、血漿の調製段階で何かコンタミしたのではと思いました。

あとは、以前に目的産物がないと測定していた際に、実はうまく測定できていなかった可能性もあるのでは。同じ系で目的産物の入っていない血漿が新しく手に入るのであれば、それを使って確認するのもありだと思います。

(無題) 削除/引用
No.11932-2 - 2023/11/19 (日) 22:18:02 - あの
3点 疑問があります。

(1)何を理由に、その古い血漿には、目的の産物が無いと判断したか

(2)RTだけではなく、msmsも含めて、目的の産物の有無を判定しているか。RTが同じ別の物質が存在する可能性はあるえますので。

(3)その産物は、古い血漿を保存している最中に作られる可能性は無いか

血漿サンプルを用いた定量試験 削除/引用
No.11932-1 - 2023/11/19 (日) 21:13:33 - きあいのタスキ学部6年生

現在、血漿サンプルを用いて目的の産物の定量試験(質量分析機器)を行っております。
予備試験として、以前の古い血漿サンプル(目的の産物は入っていない)を用いて、目的の産物がないのを確認と実験操作のおさらいをしております。
ただ、ここで問題が発生しました。
本来、目的の産物が入っていないサンプルから、当該ピークを検出してしまいました。
コンタミを疑い、調製した試薬を全て打ってみましたが、ピークは検出されませんでした。
また、base(水)でもピークは検出されません。
なぜか、目的の産物が入っていない血漿サンプルを用いても当該ピークを検出します。
マトリクス効果が原因でしょうか。

追記
カラムは古いカラムではなく、新しいカラムを使用しております。
さらに、一番最初に目的の産物をµMレベルでスタンダードとして打っております。そのRTを参考に、ピークの検出を確認しております。

7件 ( 1 〜 7 )  前 | 次  1/ 1. /1


パスワードを入力してチェックした記事を チェックした記事を

このトピックにメッセージを投稿する
名前 
メール   アドレス非公開
   タイトル 
本文      
設定  クッキーを保存(次回の入力の手間を省けます)
上に上げない(トピックの一覧で一番上に移動させません)
解決(問題が解決した際にチェックしてください)
暗証  半角英数字8-12文字の暗証番号を入れると、あとで削除、修正ができます。
送信 

〔使い方〕
  • 「アドレス非公開」をチェックすれば、自分のメールアドレスを公開しないで他の方からメールを受け取れます。
  • 問題が解決した際には、解決ボタンをチェックして解決した旨のコメントをつけてください。これは、初めにトピックを作った人と管理人のみが可能です。
  • 半角カタカナ、機種依存文字(全角ローマ数字、○の中の数字等)は文字化けの原因となりますので使わないでください。