Bio Technical フォーラム

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KrasのG12DとG12Vの違い トピック削除
No.11915-TOPIC - 2023/11/14 (火) 01:30:02 - えいと
Krasの変異に特異的に結合する化合物を独自の方法で、スクリーニングしています。

同時並行で、阻害剤の表現型解析を行う前提として、各アミノ酸置換の表現型の再現性を取っているのですが、過去の論文の再現性がことごとく、取れません。G12DとG12Vの違いを緻密に解析するには、相当な工夫が必要なのでしょうか。。

何度も丁寧に実験していますので、1アミノ酸の違いだけで、ここまで細胞全体に及ぼす影響が違うのか、、、と疑問にすら思ってしまうのですが、、再現性を取る工夫ってありますでしょうか。


science.org/doi/10.1126/scisignal.abn2694

nature.com/articles/srep08535/figures/3
　
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(無題) 削除/引用
No.11915-2 - 2023/11/14 (火) 02:54:46 - おお
発現量がそろわないと比較がしにくそうですし、安定導入株だったらIntegrationの位置でも変わってくると思いますし、解釈が難しい実験かと思います。示された論文を斜めに読み、見ていく限り彼らの実験ではこうでしたレベルで、一般化するにはまだ弱いのかもしれません（ほかにも論文がいろいろあるのなら少し話が違ってきますが）。せめて、ゲノムのKrasをターゲッティングして変異を導入する実験が今後なされるまで待った方がいいのかなという印象ですね（もしまだやられてないなら）。ただ、これまでの臨床、その他の実験などの全体的な印象と合致する面もあったのかもしれません。

再現性が取れないならそれはあなたの系ではその限りではないという結果もありうると思います。あるいは示された論文に基づくならば、著者にその細胞株を分けてもらうという話もありだと思います。

KrasのG12DとG12Vの違い 削除/引用
No.11915-1 - 2023/11/14 (火) 01:30:02 - えいと
Krasの変異に特異的に結合する化合物を独自の方法で、スクリーニングしています。

同時並行で、阻害剤の表現型解析を行う前提として、各アミノ酸置換の表現型の再現性を取っているのですが、過去の論文の再現性がことごとく、取れません。G12DとG12Vの違いを緻密に解析するには、相当な工夫が必要なのでしょうか。。

何度も丁寧に実験していますので、1アミノ酸の違いだけで、ここまで細胞全体に及ぼす影響が違うのか、、、と疑問にすら思ってしまうのですが、、再現性を取る工夫ってありますでしょうか。


science.org/doi/10.1126/scisignal.abn2694

nature.com/articles/srep08535/figures/3
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