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Cas9スクリーニングにおけるnegative selectionとは トピック削除
No.11913-TOPIC - 2023/11/12 (日) 22:16:10 - DCC
初めてCas9スクリーニングを行います。

ある薬剤処理に対して、生存する細胞をスクリーニングしようと思っていますが、Cas9スクリーニングは自分も含めて、周りで行った人はいません。

元のsgRNAをリファレンスに、positive selectionを行い、sgRNAのDNAを回収して比較することはわかるのですが、それに加えて、negative selectionという概念があります。概念は理解できるのですが、実際に、どう運用されるのか、疑問で、よく調べてもわかりません。

特に我々の実験系では、生きた細胞だけ解析できるシステムになっているので、negative selectionという概念が必要なのか、わからないのですが、詳しい方アドバイスいただけないでしょうか。
　
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Cas9スクリーニングにおけるnegative selectionとは 削除/引用
No.11913-1 - 2023/11/12 (日) 22:16:10 - DCC
初めてCas9スクリーニングを行います。

ある薬剤処理に対して、生存する細胞をスクリーニングしようと思っていますが、Cas9スクリーニングは自分も含めて、周りで行った人はいません。

元のsgRNAをリファレンスに、positive selectionを行い、sgRNAのDNAを回収して比較することはわかるのですが、それに加えて、negative selectionという概念があります。概念は理解できるのですが、実際に、どう運用されるのか、疑問で、よく調べてもわかりません。

特に我々の実験系では、生きた細胞だけ解析できるシステムになっているので、negative selectionという概念が必要なのか、わからないのですが、詳しい方アドバイスいただけないでしょうか。
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