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(無題) 削除/引用 No.11887-5 - 2023/11/03 (金) 00:26:37 - おお Dishに直接RNA用LysisBufferをかけるのが常套手段だとおもいます。細胞の状態をなるべく培養時に近い状態にするべきかと思いますので。トリプシン処理とか、相当生理状態が変わりそうな気がします。わたしは培養液を除いて細胞は洗わずに直接RNA用LysisBufferをかけています（たまにタンパクもみたいのでBSAをなるべく除きたいときはPBS washをすることはあります。 まあとは言ってもSingle cellでの解析とか、ソーティングであるポピュレーションだけとかになると、そうとは言ってられないこともあるとは思います。

(無題) 削除/引用 No.11887-4 - 2023/11/02 (木) 23:07:02 - G25 trypsin処理とかスクレイパーで生化学的、機械刺激を与えると遺伝子発現プロファイルが変化する可能性もある

(無題) 削除/引用 No.11887-3 - 2023/10/31 (火) 22:26:00 - たこ PBSなどで培地は洗ってからQIAGENのRNAA prep kitのlysis bufferをぶち込んでました。 基本的には接着した状態から一気に溶かすというのが常法なような気がします。 が、trypsinで剥がしてペレットにして、-80℃においておいたことはあります。 一応それでもRINは高いしDV200も全く問題ありませんでした。

(無題) 削除/引用 No.11887-2 - 2023/10/31 (火) 21:34:11 - G25 培養液を洗い落としてから直接、RNA精製システムのLysise溶液(例えばTrizol)を皿にブッ込む。

RNA-seqをする際の細胞の回収方法 削除/引用 No.11887-1 - 2023/10/31 (火) 21:27:19 - EEE 接着細胞に刺激を行い、RNA-seqを行う予定です。 トリプシンで回収するのがいいのか、ヘラを使って回収するのがいいのでしょうか。

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