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(無題) 削除/引用 No.11830-3 - 2023/10/07 (土) 11:43:31 - おお ちなみに外れ値が含まれていてもそれにあまり引っ張られない検定方法はノンパラノＵテストとかです。ただしＮは稼げるなら３０。見るさによっては１５ぐらいでもなんとかなると思います。

(無題) 削除/引用 No.11830-2 - 2023/10/07 (土) 02:15:18 - おお ＞測定するサンプル数によって変わってくると思いますが、 ま、そういうことだと思いますが。 ｑＰＣＲの経験の豊富な方がいうに、たまに結構な外れ値が出るそうで、singlicateでなく複数測るといっていました。頻度は忘れました（１００個に一つとか？）。３つ測っておけば外れ値は認識できるし、明らかな外れ値でなくても平均することにより本来の値に近似させれますので。ｑＰＣＲのＷｅｌｌをtriplicateして有意差を出すのは、１個体どうしの比較になりますので、再現性などを示すことにはならないし、どういうデーターを示したいかよく考えたうえで統計的デザインを組むべきと思われます。例えばもし個体差が認められるのであれば同じ実験グループ（コントロールとか）の間でも個体差で有意差がつくことは大いに考えられます。 たとえばコントロールとテストなどで少なくとも１０個体ずつとか、数十匹でほかのパラメーターとの相関を見るというのであれば、多少外れ値が入っていたとしても統計的検出力を稼げますので、singlicateでもいいのかもしれません。 もし数値が外れ値かなとか思ってもう一度測定するということがあるなら、場合によっては最初から複数のＷｅｌｌを用意したほうがいいでしょう。 そのＰＩさんの指摘はなんかずれてますね。機嫌が悪かったのでしょうか。

RT-qPCRの測定回数 削除/引用 No.11830-1 - 2023/10/06 (金) 18:41:05 - Cony いつも勉強させて頂いております。 RT-qPCRで発現量を測定する時、duplicate、 triplicateで測定しているでしょうか？ 私は、マウスのT細胞を研究対象にしており、RT-qPCRの測定誤差よりも、マウスの個体間の誤差の方がはるかに大きいので、singlicateの測定でサンプル数を多くするようにしています。 研究室のmeetingで、他のラボメンバーが予備的実験で n=1 のサンプルをsinglicateで測定してるデータを出すと、PIが「triplicateで測定して、有意差検定をしろ!!」とおっしゃていました。 私が、細胞株の実験のようにサンプル数が少ない時は、triplicateでも可能だが、 マウスを扱う実験でサンプル数や実験群が増えるとtriplicateの測定は現実的ではないと言うと、 PIは、RT-qPCRは必ずtriplicateの測定で、singlicateで測定しているラボなんて聞いたことがないと仰っていました。 測定するサンプル数によって変わってくると思いますが、皆さんがどのようにして測定しているのかを教えて頂けると幸いです。 宜しくお願い致します。

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