バイオ関連の実験をする上での、試薬、機器、プロトコールなどの情報交換の場です。
新しいテーマで話を始める場合、質問をする場合は「
新しいトピックを作る
」から書き込みをしてください。
質問に対して解答できる方は是非、書き込んで下さい。
このフォーラムにふさわしくないと管理人が判断した投稿は予告なく削除します。
新しいトピックを作る
|
トピック一覧
|
研究留学ネットに戻る
ひとつ前のフォーラム(readのみ)
このスレッドをはてなブックマークに追加
ensemble の検索結果の出力
トピック削除
No.11818-TOPIC - 2023/10/02 (月) 15:30:56 - もち
ensembleで遺伝子のキーワード検索でヒットしてきたgeneのgene IDなどのリストをファイルに出力する方法を教えてください。
NCBIではgene ID やらaccession IDやらgene descriptionやらが記載された検索結果を出力できるのですが、ensemble IDのリストが欲しい状況です(今はNCBIで出力したIDをbiomartでensemble IDに変換していますが直接できないかと思いまして.....)
-
このトピックにメッセージを投稿する
-
全
4
件 ( 1 〜 4 ) 前 | 次
1
/
1.
/
1
(無題)
削除/引用
No.11818-4 - 2023/10/04 (水) 09:24:13 - ume
なんでしょうそのエラー。若干今日重たい気がするのでそのせいかもしれないですね。
以下に、私が接続できたURLを載せますね。頭にhを補ってください。
ttps://asia.ensembl.org/Multi/Search/Results?q=oct4;site=ensembl;style=table
これでうまくアクセスできない場合は、もちさんの環境に何か問題がある可能性があります(ブラウザ、firewall、地域?など)。
(無題)
削除/引用
No.11818-3 - 2023/10/03 (火) 21:44:22 - もち
tableアイコンを押すとなぜかエラーが出て、Please check that you have typed in the correct URL or else use the site search facility to try and locate information you require.
If you think an error has occurred, please contact our HelpDesk というメッセージが出て来てしまいます......
(無題)
削除/引用
No.11818-2 - 2023/10/03 (火) 09:47:09 - ume
ensembleでキーワード検索した結果の画面で、layoutをTableにして、右上のエクセルのマークをクリックしたら手に入りませんか?
1000までしかダウンロードできなそうですが。
ensemble の検索結果の出力
削除/引用
No.11818-1 - 2023/10/02 (月) 15:30:56 - もち
ensembleで遺伝子のキーワード検索でヒットしてきたgeneのgene IDなどのリストをファイルに出力する方法を教えてください。
NCBIではgene ID やらaccession IDやらgene descriptionやらが記載された検索結果を出力できるのですが、ensemble IDのリストが欲しい状況です(今はNCBIで出力したIDをbiomartでensemble IDに変換していますが直接できないかと思いまして.....)
全
4
件 ( 1 〜 4 ) 前 | 次
1
/
1.
/
1
パスワード
を入力してチェックした記事を
チェックした記事を
このトピックにメッセージを投稿する
名前
メール
アドレス非公開
タイトル
本文
設定
クッキーを保存(次回の入力の手間を省けます)
上に上げない(トピックの一覧で一番上に移動させません)
解決(問題が解決した際にチェックしてください)
暗証
半角英数字8-12文字の暗証番号を入れると、あとで削除、修正ができます。
送信
〔使い方〕
「アドレス非公開」をチェックすれば、自分のメールアドレスを公開しないで他の方からメールを受け取れます。
問題が解決した際には、解決ボタンをチェックして解決した旨のコメントをつけてください。これは、初めにトピックを作った人と管理人のみが可能です。
半角カタカナ、機種依存文字(全角ローマ数字、○の中の数字等)は文字化けの原因となりますので使わないでください。